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嫌気培養酵母の形質転換 トピック削除
No.1304-TOPIC - 2013/01/05 (土) 03:13:18 - koubo
Saccharomyces cerevisiaeのergosterol生合成酵素遺伝子の遺伝子欠損株の構築を計画中なのですが、好気条件下で目的遺伝子を欠損すると、sterol合成能を失った状態で、外部から添加したergosterolを取り込めないため破壊株が生育できなくなってしまうのではないかと考えています。
ちなみに、嫌気条件下では外部ergosterolを取り込めるという前情報はあります。

この場合、好気条件で生育した酵母プロトプラストで形質転換し、嫌気条件で培養すれば良いのでしょうか?
それとも、嫌気条件下で培養した酵母を用いて形質転換を行うべきでしょうか?
遺伝子破壊のプロトコールは大体好気条件下で培養した菌体を想定しているようですが、それは可能なのでしょうか?
また、嫌気条件下でのプレーティングの条件は密封しておけば良いのでしょうか?

経験がある方がいらっしゃれば、ご意見を伺いたいです。
よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.1304-3 - 2013/01/05 (土) 21:54:36 - 弘法
具体的にはどの遺伝子を欠損させようとしているのですか?

(無題) 削除/引用
No.1304-2 - 2013/01/05 (土) 04:28:52 - おお
あまり詳しいものではないのですが、まあいろいろやってみるしかないでしょう。遺伝子を導入するステップは個人的にはいじると微妙な気がしますので、その後の培養条件をいじった方がいいかとおもえますけど。

>外部から添加したergosterolを取り込めないため破壊株が生育できなくなってしまうのではないかと考えています。

理論的根拠のようですが、実験的根拠はありますか?毒性がなければ可也多くの量をバイチに添加できますし、実際入らないと言われているものでも、外部濃度から比べてごく僅かでも十分生育できるといったことは、ほかの例ではあるかと思えます。

破壊したい遺伝子は破壊株のコレクション(ライブラリーなど)あると思いますのでそういうのをみると容易に破壊できるかわかるかもしれません。

もう一つの案は破壊したい遺伝子をプラスミドで発現した状態で、ゲノムの破壊を行うのもてだと思います。プラスミドはネガティブセレクション(キックオフ)ができるマーカーがあれば、あとで好みの条件下で落とすことができる可能性がありますので。誘導性のものだとプラスミドを落とす作業はいらないかもしれませんけど。


あと密閉したからといって嫌気的になるかというと、、、厳密な微生物培養で嫌気というのは酸素吸収剤を入れて密閉した容器の中で培養したりしますよね。酵母の場合はどのコンディションで嫌気的な呼吸がドミナントになるのか分かりませんけど。

嫌気培養酵母の形質転換 削除/引用
No.1304-1 - 2013/01/05 (土) 03:13:18 - koubo
Saccharomyces cerevisiaeのergosterol生合成酵素遺伝子の遺伝子欠損株の構築を計画中なのですが、好気条件下で目的遺伝子を欠損すると、sterol合成能を失った状態で、外部から添加したergosterolを取り込めないため破壊株が生育できなくなってしまうのではないかと考えています。
ちなみに、嫌気条件下では外部ergosterolを取り込めるという前情報はあります。

この場合、好気条件で生育した酵母プロトプラストで形質転換し、嫌気条件で培養すれば良いのでしょうか?
それとも、嫌気条件下で培養した酵母を用いて形質転換を行うべきでしょうか?
遺伝子破壊のプロトコールは大体好気条件下で培養した菌体を想定しているようですが、それは可能なのでしょうか?
また、嫌気条件下でのプレーティングの条件は密封しておけば良いのでしょうか?

経験がある方がいらっしゃれば、ご意見を伺いたいです。
よろしくお願いします。

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