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(無題) 削除/引用 No.1340-4 - 2013/01/17 (木) 09:48:01 - み qPCRマシーンが無いなら昔やっていた半定量PCRでも良いのでは？ サイクル数を振ってアガロースゲル電気泳動で増幅度合いを比較するってやつ。

(無題) 削除/引用 No.1340-3 - 2013/01/16 (水) 15:05:56 - おお qPCRをしなさい。

(無題) 削除/引用 No.1340-2 - 2013/01/16 (水) 14:33:26 - まて茶 (補足 懸念しているところは、各サンプルごとに用いてるゲルが違う点（ゲルの種類、濃度ではなく） 各サンプルの比較で、単純に任意に基準となるサンプルを決めて、intensity/intensityで比を求める方法でいいのか疑問です。

マイクロアレイデータ解析 削除/引用 No.1340-1 - 2013/01/16 (水) 14:20:07 - まて茶 いつもお世話になっています。 現在、マイクロアレイをアガロースゲル上で再現しようとしています。 方法としては、cDNAライブラリー溶液（サンプル）を個別のプライマーでPCRしプライマーの数だけのレーンを用いて、電気泳動し、DNAのバンドをサイバーグリーン（蛍光試薬）で染めるという方法です。 各サンプルから、プライマーの数だけ、インテンシティーとしてデータが得られています。例えば3種類のcDNAライブラリーで8種類のプライマーを用いたらインテンシティーは24得られます。 　ここで、８種類のプライマーによるPCRの増幅は等しいと考えて、各プライマーにより増幅されたDNAの増減率を解析したいのですが、何かいい解析法を教えていただきたい。 　（知りたい事は各サンプルを比較して、どのプライマーで増やされたDANがどれだけ増加しているかという情報です）。 よろしくお願いします。

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