いつも大変お世話になっております。
IPでEndogenousのタンパクの結合を見ております。タンパク(A)をIPする抗体が、マウスIgG2モノクロナール抗体なので、コントロールとして、等量(5ug)のnormal mouse IgG (poryclonal)を使用しています。ところが、タンパク(B)抗体(マウス)を用いたWestern Blotをした際、コントロールIgG重鎖のバンドがIP抗体(A)のIgG重鎖バンドよりも2倍以上大きく、コントロールなのにその他の部位にも非特異なバンドが多く見られます。NormalIgGのレーンの方がIgGが濃くなっているようです。そのため、IP抗体(A)を用いたレーンに見られるバンドが本当にタンパク(B)なのかどうか自信が持てず、困っています。IP抗体と等量のNormalIgGを使っているのに、なぜIgG重鎖バンドの大きさが明らかに異なるのでしょうか?この場合、どのように対処したらよいでしょうか(勝手にNormalIgGの量を減らしてもよいものかどうか)?Lysateは細胞から0.1%NP40とSonicationで抽出し、タンパク量約1.8rのLysateをProteinAで30分Precleanの後、IP抗体(またはNormalIgG)で2時間、その後ProteinAを30ul加えて1時間インキュベートしています。抗体はタンパク量1.8mgに対して毎回5ug使用しています。ご教示のほどよろしくお願い申し上げます。 |
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