Bio Technical フォーラム

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geNormソフトのパラメーター トピック削除
No.1601-TOPIC - 2013/04/02 (火) 15:24:24 - マロン
リアルタイム定量PCRで標準化を行う遺伝子(レファレンス遺伝子)を評価するgeNormソフトウェアについて質問です。原文献(Jo Vandesompele, Katleen De Preter, Filip Pattyn, Bruce Poppe, Nadine Van Roy, Anne De Paepe and Frank Speleman* Genome Biology 2002, 3:research0034-research0034.11) を読みましたが、必要な遺伝子数を見積もるのに用いられるV(3/4)などのパラメーターの計算方法が分かりません。Vは2つの遺伝子間のデータで算出される値なので、これを3つ、4つの遺伝子について計算するというのはどういう計算を行っているのか?計算式が出ている文献や、webページがあったら教えていただけると助かります。よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.1601-2 - 2013/04/03 (水) 18:19:33 - 僕
3年間くらい前に以前勤めていた会社でgeNormを使っていましたが、どのような計算を使っているのか私も気になって、試した事があります。残念ながら計算式までは憶えていないのですが、エクセルを使って算出できる単純なものだったと記憶しています。ご希望に添うような回答ではないかもしれませんが、ご参考までに。

geNormソフトのパラメーター 削除/引用
No.1601-1 - 2013/04/02 (火) 15:24:24 - マロン
リアルタイム定量PCRで標準化を行う遺伝子(レファレンス遺伝子)を評価するgeNormソフトウェアについて質問です。原文献(Jo Vandesompele, Katleen De Preter, Filip Pattyn, Bruce Poppe, Nadine Van Roy, Anne De Paepe and Frank Speleman* Genome Biology 2002, 3:research0034-research0034.11) を読みましたが、必要な遺伝子数を見積もるのに用いられるV(3/4)などのパラメーターの計算方法が分かりません。Vは2つの遺伝子間のデータで算出される値なので、これを3つ、4つの遺伝子について計算するというのはどういう計算を行っているのか?計算式が出ている文献や、webページがあったら教えていただけると助かります。よろしくお願いします。

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