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Bonferroni correction/Bonferroni Step-down (Holm) correction トピック削除
No.1660-TOPIC - 2013/04/20 (土) 13:26:05 - おお
Bonferroni correction/Bonferroni Step-down (Holm) correction

なんですが、3つサンプルがあるとします。総当たりなら3つの組み合わせがあるわけです。

たとえばその全部の組み合わせのp値を補正するならえられたp値を三倍にすればBonferroniの補正がかけれたことになります。Bonferroni Step-down (Holm) correction なら最小のp値を3倍次に小さいp値を2倍にして補正をかけていけばいいわけですよね。

では3つの組み合わせのうち2つの組み合わせしか検定しないとなると、Bonferroniの補正のばあいは2倍してほせいすればいいと思いますが、まちがってますか。

付随して統計ソフトはどんな場合もすべての組み合わせでp値をだすという前提で補正がかけられているのでしょうか。だとすると、4つのグループで2つの組み合わせは6こあると思うのですが、3つのj組み合わせだけのp
値を見たい場合は、補正がふてきせつではありませんか?
 
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(無題) 削除/引用
No.1660-7 - 2013/04/22 (月) 12:19:03 - おお
Tukey-Kramerは得られた数字がスタンダードなどけいさんできるなどで毎回理論的に同じ数字が期待できるときにはつかっております。

(無題) 削除/引用
No.1660-6 - 2013/04/22 (月) 12:14:01 - おお
ちなみに手元にある2のp値は0.2ぐらいと、0.01強で3グループで総当たりと考えた補正でも、2つp値を出したということで補正でも、一方は5%を有意水準とした場合有意とでますし、どう転んでも1%より低い数字にはなりません。なので今回のデーターを意図的に有意にしたいというわけでなく、次からこのような場合、最初から検定の筋道をつけてから計算できるようにと思っているわけです。

(無題) 削除/引用
No.1660-5 - 2013/04/22 (月) 10:38:34 - おお
>[Re:4] qqさんは書きました :
> リファレンスは用意できません。それよりもTukey-Kramerでいいんじゃないと思いますがどうなんでしょうか?
>
> トピの真意は「対照;処理1;処理2がある時に、処理1と処理2を比較することに本質的な意味が無いので、p値の補正にも除外すべきだろう」と、言うことでしょうか?
> そういえば、以前対応のある多群比較の話をしていましたっけ?
> 3群のとき、[処理1−対照]と[処理2−対照]をただのt-tstにかけても問題ないのか?
> 問題なければ、補正はいらなくなるけどそんな話、聞いたこと無い。
> 4群の時に、[処理1−対照]と[処理2−対照]と[処理3−対照]の3群に落とし込めそうです。
> だけど、そこに実質的な対応があるのかという点で釈然としません。
> 無理にp値を小さくするなと言っているのではないでしょうか?

えっと真意といいますか、2つの補正かけてないp値が手元にあるわけです。でこれは3群から来ているのですけど、すでに手元にp値もあるわけですし、補正といっても単なる掛算ですしすぐ計算できるので、、、とおもったときはてと思いました。2回しか検定していませんので補正は2回分にたいして行えばいいはずと思ったわけです。

対応を持ち込んでるというのは、ちょっと言い方を変えますが、オートラその他でいつもデンシドなどの値が違うので、対象を1として3回のオートラの結果を統計処理するとかいう感じになるので、要するに差を検定しているわけです(対応ありの検定と計算方法になるかとおもいます)。この場合ちょっと多重比較で手元にあるソフトでどの検定方法を選んで良いかよく分からないのです。

(無題) 削除/引用
No.1660-4 - 2013/04/22 (月) 09:50:43 - qq
リファレンスは用意できません。それよりもTukey-Kramerでいいんじゃないと思いますがどうなんでしょうか?

トピの真意は「対照;処理1;処理2がある時に、処理1と処理2を比較することに本質的な意味が無いので、p値の補正にも除外すべきだろう」と、言うことでしょうか?
そういえば、以前対応のある多群比較の話をしていましたっけ?
3群のとき、[処理1−対照]と[処理2−対照]をただのt-tstにかけても問題ないのか?
問題なければ、補正はいらなくなるけどそんな話、聞いたこと無い。
4群の時に、[処理1−対照]と[処理2−対照]と[処理3−対照]の3群に落とし込めそうです。
だけど、そこに実質的な対応があるのかという点で釈然としません。
無理にp値を小さくするなと言っているのではないでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.1660-3 - 2013/04/22 (月) 07:59:26 - おお
>[Re:2] qqさんは書きました :
> >では3つの組み合わせのうち2つの組み合わせしか検定しないとなると、
> 3つの組み合わせ全てを検定するけど、2つの組み合わせしか表示しないのが、きっと正しいので、補正はそのまま3倍するのがBonferroni的だと思います。
>
>

ありがとうございました。なにかreferenceなどのようなものがありませんでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.1660-2 - 2013/04/21 (日) 21:26:32 - qq
>では3つの組み合わせのうち2つの組み合わせしか検定しないとなると、
3つの組み合わせ全てを検定するけど、2つの組み合わせしか表示しないのが、きっと正しいので、補正はそのまま3倍するのがBonferroni的だと思います。

Bonferroni correction/Bonferroni Step-down (Holm) correction 削除/引用
No.1660-1 - 2013/04/20 (土) 13:26:05 - おお
Bonferroni correction/Bonferroni Step-down (Holm) correction

なんですが、3つサンプルがあるとします。総当たりなら3つの組み合わせがあるわけです。

たとえばその全部の組み合わせのp値を補正するならえられたp値を三倍にすればBonferroniの補正がかけれたことになります。Bonferroni Step-down (Holm) correction なら最小のp値を3倍次に小さいp値を2倍にして補正をかけていけばいいわけですよね。

では3つの組み合わせのうち2つの組み合わせしか検定しないとなると、Bonferroniの補正のばあいは2倍してほせいすればいいと思いますが、まちがってますか。

付随して統計ソフトはどんな場合もすべての組み合わせでp値をだすという前提で補正がかけられているのでしょうか。だとすると、4つのグループで2つの組み合わせは6こあると思うのですが、3つのj組み合わせだけのp
値を見たい場合は、補正がふてきせつではありませんか?

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