Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

フェノクロto トピック削除
No.1687-TOPIC - 2013/04/28 (日) 16:42:07 - フェノクロ
いつも大変お世話になっております。

これまで、DNA抽出時に何回もフェノール抽出やフェノクロ抽出をしましたが、恥ずかしながら、いつも何も考えずに水性溶液と等量加えて遠心、上清をとっていました。

少なすぎると、蛋白や脂溶成分の除去の低下を招き、多すぎるとDNAのフェノール層への移行を招くと思いますが、混入する脂溶成分や蛋白の量はクルードなサンプルと、精製後の酵素反応後のサンプルではだいぶ異なるし、DNA量もまちまちです。しかし私はいつも必ずフェノールやフェノクロはDNA溶液と等量で入れようとして、不純物が多い場合は抽出回数を増やすことで除去してきました。とは言え,中には間違えて1:2位になったこともありますが、サザンブロットで問題が起きたことはありませんでした。

何故、どのサンプルでも等量のフェノールを加え、サンプルの濃度や純度に応じてフェノクロ3に水性溶液1やその逆を行うことは無いのか、ご教示ください。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.1687-4 - 2013/04/28 (日) 22:39:49 - 中年
エマルジョンになったときの水相と有機相の接触表面積が大きくなるように1:1にしているのだろうと思っていました。

(無題) 削除/引用
No.1687-3 - 2013/04/28 (日) 17:16:19 - おお
>[Re:2] おおさんは書きました :
> 有機層をふやすと、水層の回収率が下がりませんか?

あ、そんなことはないですね、水層の容量を'減らさなければ、、、しつれいしました。

(無題) 削除/引用
No.1687-2 - 2013/04/28 (日) 17:13:18 - おお
有機層をふやすと、水層の回収率が下がりませんか?
私は精製された核酸の酵素処理などのあとにフェのクロの必要がある場合は有機層をへらしてます。先細りしているエッペンではそれのほうが水層のロス(取残し)が減りますから。

フェノクロto 削除/引用
No.1687-1 - 2013/04/28 (日) 16:42:07 - フェノクロ
いつも大変お世話になっております。

これまで、DNA抽出時に何回もフェノール抽出やフェノクロ抽出をしましたが、恥ずかしながら、いつも何も考えずに水性溶液と等量加えて遠心、上清をとっていました。

少なすぎると、蛋白や脂溶成分の除去の低下を招き、多すぎるとDNAのフェノール層への移行を招くと思いますが、混入する脂溶成分や蛋白の量はクルードなサンプルと、精製後の酵素反応後のサンプルではだいぶ異なるし、DNA量もまちまちです。しかし私はいつも必ずフェノールやフェノクロはDNA溶液と等量で入れようとして、不純物が多い場合は抽出回数を増やすことで除去してきました。とは言え,中には間違えて1:2位になったこともありますが、サザンブロットで問題が起きたことはありませんでした。

何故、どのサンプルでも等量のフェノールを加え、サンプルの濃度や純度に応じてフェノクロ3に水性溶液1やその逆を行うことは無いのか、ご教示ください。

4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。