現在とある蛋白質のアイソフォームを調べています。
この蛋白は研究対称種では早期に終止コドンが出現し、非常に短い蛋白質しか作られないのですが、ある疾患モデルのサンプルから得られたmRNAではその発現量が非常に増大していました。
終止コドンは含まれているので、最初のATGから始まる蛋白はそこで止まるはずですが、終止コドンの下流の配列でもいくつか複雑なスプライシングパターンを持つ複数のアイソフォームが確実に増加しているので、もしかしたら終止コドン以下の配列から再び蛋白質が発現しているのではないかと疑っています。in vitro translationさせる以外の方法でこれを証明することは可能でしょうか?
もしくは開始コドンの読みもらし(leaky scanning)の検索方法、共通モチーフ配列等存在するのでしょうか?ラボのメンバーは遺伝学に強くないため手探り状態です。宜しくお願い致します。 |
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