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ライセートからのポリユビキチン結合タンパク質の濃縮/抽出 トピック削除
No.2111-TOPIC - 2013/06/17 (月) 21:09:29 - ぽりこ
ポリユビキチンに結合するタンパク質に着目しております。特定のユビキチン化されたタンパク質を認識するものである必要はなく、とにかくユビキチン/ポリユビキチンに結合するライセート内のタンパク質をすべて抽出したいと考えてます(ユビキチン化されたタンパク質の抽出ではなく、ユビキチン/ポリユビキチンを認識して結合するタンパク質です)。


単純に考えて、ポリユビキチンを結合させたビーズなどがあればと思っているのですが、見当たりません。

どなたか、ご存知のから、もしくは他の方法など教えて下さい。
 
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No.2111-5 - 2013/06/18 (火) 13:59:27 - ぽりこ
皆様、コメントありがとうございます。


>[Re:3] 中年さんは書きました :
> ポリユビキチンは市販されていますよね。ビオチン化されたものもあるようなので、アフィニティー担体として使えるでしょう。
>
> http://www.bostonbiochem.com/products/ubiquitin/ubiquitin-chains

まさに望んでいた試薬です。これを使えば、プルダウンができそうですね。ポリユビキチンは50ugで2万円ぐらいか。まぁまぁな価格ですね。でもアフィニティーが高ければ文句ないですね。こればっかりは使用してみないとですね。

(無題) 削除/引用
No.2111-4 - 2013/06/18 (火) 10:24:31 - maru
ユビキチン同士が連結する残基は複数あって場所によって役割が違うと思うので気をつけた方がいいとおもいます。

(無題) 削除/引用
No.2111-3 - 2013/06/18 (火) 08:34:37 - 中年
ポリユビキチンは市販されていますよね。ビオチン化されたものもあるようなので、アフィニティー担体として使えるでしょう。

http://www.bostonbiochem.com/products/ubiquitin/ubiquitin-chains

(無題) 削除/引用
No.2111-2 - 2013/06/18 (火) 02:09:37 - おお
おもしろいですね。方法論がほんとにないとするなら新しい知見がえられるかもしれません。

やりようが幾らかあるとは思いますが、、、

ポリユビキチン化したタンパクが手に入るなら、2種類のタンパクでタンデムに精製すれば、ポリユビキチン以外を認識しているタンパクは落ちるはずですよね。

デユビキチネーションする酵素も核酸のヌクレアーゼのように切り方にいろいろ種類があるので、ポリユビキチンをユビキチン化タンパクから抽出できるかもしれませんよ。

ライセートからのポリユビキチン結合タンパク質の濃縮/抽出 削除/引用
No.2111-1 - 2013/06/17 (月) 21:09:29 - ぽりこ
ポリユビキチンに結合するタンパク質に着目しております。特定のユビキチン化されたタンパク質を認識するものである必要はなく、とにかくユビキチン/ポリユビキチンに結合するライセート内のタンパク質をすべて抽出したいと考えてます(ユビキチン化されたタンパク質の抽出ではなく、ユビキチン/ポリユビキチンを認識して結合するタンパク質です)。


単純に考えて、ポリユビキチンを結合させたビーズなどがあればと思っているのですが、見当たりません。

どなたか、ご存知のから、もしくは他の方法など教えて下さい。

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