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(無題) 削除/引用 No.2182-6 - 2013/07/11 (木) 06:40:27 - AAA >> mbb様 丁寧な解説をありがとうございます。 正直、英語、MSの単語の両方に不安がありました。 いただいた情報をもとにもう少し勉強してから 交渉にはいろうと思います。

(無題) 削除/引用 No.2182-5 - 2013/07/10 (水) 13:53:41 - mbb 英語が苦手なのか、MSの単語が出てきて理解しにくいのか、 どちらでしょうか？引用された英文は、少しMSをかじった 程度の人であればわかる程度の内容かと思います。 とりあえず英語としては ・MALDIで陰イオンとしてとれるので、ESIも同じだろう ・肺中のカルジオリピンを測定するのは難しいだろう ・HPLCで分離する必要があるだろう ・標準品があれば試してみよう MSの意味としては ・MALDIとESIは分子のイオン化方法です。 ・MALDIはLCとオンラインでつなげることはあまりなく 普通はHPLCででてきた溶出液を直接ESIでイオン化し、 MS（四重極）で測定します。 ・委託先にMALDI-TOFしかないのであれば、ESIの話が 出たのがよくわかりません。

(無題) 削除/引用 No.2182-4 - 2013/07/10 (水) 12:14:51 - AAA >> mbb様 >> cDNA様 いろいろなアドバイスありがとうございます。とても参考になりました。 さて、さっそく先方とコンタクトをとったところ、以下のような返事が来ました。 引用始まり Cardiolipin can be analyzed by MALDI in negative mode, using 9-aminoacridine as the matrix. It can be analyzed by ESI as well. Measuring the molecule in lung is likely to be a long shot though, since it is only found in mitochondrial inner membranes. Extracts may need to be separated by HPLC to isolate polar lipids. I’m willing to give it a try if they provide the cardiolipin standard. 引用終わり 一応近々先方(うち一人はPh.D.でMSに精通しているようです)と会って話すことになりそうですが、上記の内容がよく分かりません。英語でのディスカッションなので、おおまかな事は知っといたほうがいいと思うのですが、どなたか補足説明をお願いできないでしょうか ?　標準物質(E.coliのカルジオリピン)は25mgで$485、100mgで $1390で入手可能のようです。機械の使用料は $50/hr程度、HPLCでのseparationは$70/sample程度のようです。 ちなみにホームページをみてみると、MALDI Time-of-Flight MS (ABI Voyager DE STR)とMALDI TOF/TOF MS (The ABI 4700)の２機が使用可能のようです。

(無題) 削除/引用 No.2182-3 - 2013/07/10 (水) 11:05:26 - ｃDNA 委託と書かれていますが、そのセンターの位置付けと課金方針、センター職員の身分、興味によって状況が全く異なってきます。 お金さえ払えば何でも測定してくれるのか、共同研究としてしか請け負ってくれないのか、基本操作は教えてくれるけど依頼者が測定からしないといけないのかなど。 出来るだけ勉強してから臨むのはいいことですが、素人だと伝えて委託先と相談する事が大事です。 MSに関して素人と書かれていますが、脂質に関しては如何でしょうか？先方もMSの専門家でも脂質の専門家でなければ論文にするときにいろいろ問題が起きることもあります。そこもお構いなしで依頼されたらただ測定する、というところもあるので慎重に見極めた方がよろしいかと思います。 測定のコストですが、センターがMSの年間維持を完全にしてくれていて、わずかな消耗品分を課金するような場合は1000円程度で行けると思いますが、年間維持費を使用料で賄う方針でしたら数万請求されてもおかしな話ではありません。そこを共同研究扱いにすると課金がぐっと安くなるとか、状況次第だと思いますので、センターに相談するのが一番だと思います。

(無題) 削除/引用 No.2182-2 - 2013/07/10 (水) 10:26:10 - mbb おそらく研究センターの利用案内にその辺のことは書かれていると 思うのですが、わからなかったらセンターの受付の方に質問する ほうが良いと思います。 とりあえず >1. そこでなのですが、委託するにあたり、どのような >情報を先方にわたす必要があるのでしょうか ? 分子量、ExactMass、化学式、構造式、おこなった前処理などの 情報は分析するほうとしては欲しいと思います。 >2. 過去に同様な定量を行ったペーパーが複数あるので >それを先方にみせたら、細かい条件設定、解析など、やって >もらえるのでしょうか ? 施設の方針とか担当者の技能とか忙しさとかによりそうですが 論文の情報はあったほうが分析しやすいと思います。解析は ご自身でやることも念頭に入れておいたほうが良いかと思います。 >3. 定量のための標準物質が必要となるのでしょうか ? 普通標準品がないと検量線を作れないので定量できません。 必要に応じてinternal standardもいります。 4. サンプルはどのように処理すべきでしょうか ? (液体窒素保存 ?) 前処理でほぼ精製できたものを渡したほうが好ましいです。 保存方法は目的物質の性質によるので何ともいえませんが、 析出しない状態で低温で保存するのが好ましいです。 酸化しやすいサンプルなら不活性ガス雰囲気で密封する必要も あるかもしれません。 >4. LC-MSで定量するとして一般的にどのくらいの費用が >かかるものなのでしょうか ? 1サンプルで1000円以上かかった覚えがありますが、施設によって 価格は異なると思います。

カルジオリピンの質量分析 削除/引用 No.2182-1 - 2013/07/09 (火) 17:35:51 - AAA 質量分析についてはほとんどずぶの素人です。 今、マウスの肺組織におけるカルジオリピンの定量を 考えており、質量分析を大学内にある他の研究センター に委託しようかと考えています。 1. そこでなのですが、委託するにあたり、どのような 情報を先方にわたす必要があるのでしょうか ? 2. 過去に同様な定量を行ったペーパーが複数あるので それを先方にみせたら、細かい条件設定、解析など、やって もらえるのでしょうか ? 3. 定量のための標準物質が必要となるのでしょうか ? 4. サンプルはどのように処理すべきでしょうか ? (液体窒素保存 ?) 4. LC-MSで定量するとして一般的にどのくらいの費用が かかるものなのでしょうか ? どなたか脂質の質量分析に関して詳しい方がいましたら教えていただけないでしょうか ?

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