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RNA抽出 水層の逆転 トピック削除
No.2387-TOPIC - 2013/09/21 (土) 02:41:56 - momo
いつもお世話になります。

QIAAolを用いて血清からRNA抽出を行ったところ、1サンプルのみ、3層に分かれた際、最下層のピンクの層と一番上のRNAが含まれている層が逆転しました。RNAが含まれている水層を、コンタミなしで取り出すことが難しいです。

原因と対処方法を教えていただけないでしょうか。
 
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感謝 削除/引用
No.2387-7 - 2013/09/24 (火) 10:13:31 - momo
皆様
週末にもかかわらずたくさんのアドバイスをいただき、ありがとうございました。
本日、同じ血清を用いてやり直してみました。
他のサンプルと条件を変えたくなかったので、まずはしっかり混和することを意識して行いました。層の逆転現象は見られませんでした。
今回のサンプルは余分があったためやり直しができましたが、そうではないことが多いため、次回同じ現象に遭遇した際は皆様のアドバイスを試してみようと思います。

ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.2387-6 - 2013/09/24 (火) 01:04:03 - NUPD
TRizolで50くらいのサンプルのRNA抽出を行うと
同様の現象が1-2サンプルほどなぜか出てくるのを
経験したことが何回かありますが
もう一回シェイクするなり何なりでよく混ぜて
遠心をすれば大体ちゃんと水層が上に着ましたよ。
特に何かを加えたりもしてないので
PHや塩濃度の辺りも気にしないでいいので
とりあえずそうやってみてはいかがでしょうか。
それでも改善されない場合はやはりカスタマーサポートですかね。。。

(無題) 削除/引用
No.2387-5 - 2013/09/24 (火) 00:07:53 - 直輝
単純に、血清に対するQIAzolの割合を増やせば逆転が解消するんじゃないかな?

(無題) 削除/引用
No.2387-4 - 2013/09/23 (月) 23:58:55 - おお
水をくわえると、次のステップで支障がないでしょうか。えたちんするなら塩濃度もかわるので、、、0.3M酢酸ナトリウムあたりなら、えたちんの支障は回避できると思いますが。

(無題) 削除/引用
No.2387-3 - 2013/09/23 (月) 19:47:00 - ふみ
水層の容量に対して1-3割ほどの水を加えてからよく混ぜて遠心してみたらどうでしょうか。加えるときは、水層の比重が減って上に来るまで少しずつ水を加えると宜しいと思います。

(無題) 削除/引用
No.2387-2 - 2013/09/21 (土) 02:52:16 - おお
アイデアとして書いているので、保障はありませんが、ピンクの層をのぞいて、更にその試薬 (trizolみたいなものとおもっていますが)、あるいはtrizolを加えて、クロロフォルムをくわえて遠心してみるとか。。。

ちょっとそのキットの内容を把握してないので確認できる時にみてみますけど。

多分脂質とか夾雑物が一杯あって邪魔してるんじゃないかなぁと、、、

RNA抽出 水層の逆転 削除/引用
No.2387-1 - 2013/09/21 (土) 02:41:56 - momo
いつもお世話になります。

QIAAolを用いて血清からRNA抽出を行ったところ、1サンプルのみ、3層に分かれた際、最下層のピンクの層と一番上のRNAが含まれている層が逆転しました。RNAが含まれている水層を、コンタミなしで取り出すことが難しいです。

原因と対処方法を教えていただけないでしょうか。

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