Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

IRESの前後の配列と発現量について トピック削除
No.2412-TOPIC - 2013/10/01 (火) 15:55:00 - IRES2
いつも皆さんの意見を参考にさせていただいております。

タイトルにありますように、A-IRES-Bのようなコンストラクトを作製し、2つのタンパクをさせようと考えています。
Bのタンパク発現は何に依存するのでしょうか?
一つはA遺伝子の発現量(A遺伝子の前のプロモーター活性)が高ければBも高い発現量になると思っています。
理研のIRES2ベクターを参考にいたしますと、IRES2の後ろにACC-ATG...と配列がありますので、IRES2のうしろに余分な配列が続くと発現量が落ちてしまうのではないかと考えています。
現在考えている方法だと、IRES2の後ろに15塩基-ATG...というコンストラクトになります。
理研のものはたった3塩基ですが、私の現在考えているものは15塩基と非常に長く感じ、またこれがB遺伝子の発現に非常に大きな影響を与えるのであれば考え直さなければいけません。

皆様のご意見お待ちしております。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.2412-5 - 2013/10/04 (金) 09:33:38 - IRES2
>MPさん

ご紹介いただいた論文を読ませていただきます。
ありがとうございます。


>Harmoniaさん

http://www.brc.riken.jp/lab/cfm/Subteam_for_Manipulation_of_Cell_Fate_J/Plasmid_List_J.html
三好浩之先生のラボからの供与物になります。

具体的にはCSII-CMV-MCS-IRES2-VenusのようなレンチウイルスベクターからPCRで拾うことを考えています。

(無題) 削除/引用
No.2412-3 - 2013/10/04 (金) 08:22:20 - Harmonia
「理研のIRES2ベクター」って?
どの研究室の何という名前のベクター?

(無題) 削除/引用
No.2412-2 - 2013/10/01 (火) 17:18:18 - MP
以下の論文が参考になるかと思います。

Biotechniques. 2006 Sep;41(3):283-4,
Translational efficiency of EMCV IRES in bicistronic vectors is dependent upon IRES sequence and gene location.
Bochkov YA, Palmenberg AC.

IRESの前後の配列と発現量について 削除/引用
No.2412-1 - 2013/10/01 (火) 15:55:00 - IRES2
いつも皆さんの意見を参考にさせていただいております。

タイトルにありますように、A-IRES-Bのようなコンストラクトを作製し、2つのタンパクをさせようと考えています。
Bのタンパク発現は何に依存するのでしょうか?
一つはA遺伝子の発現量(A遺伝子の前のプロモーター活性)が高ければBも高い発現量になると思っています。
理研のIRES2ベクターを参考にいたしますと、IRES2の後ろにACC-ATG...と配列がありますので、IRES2のうしろに余分な配列が続くと発現量が落ちてしまうのではないかと考えています。
現在考えている方法だと、IRES2の後ろに15塩基-ATG...というコンストラクトになります。
理研のものはたった3塩基ですが、私の現在考えているものは15塩基と非常に長く感じ、またこれがB遺伝子の発現に非常に大きな影響を与えるのであれば考え直さなければいけません。

皆様のご意見お待ちしております。

4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。