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native pageで核酸分離は可能か トピック削除
No.316-TOPIC - 2012/03/19 (月) 16:35:47 - pop

 いつも大変お世話になっております。
 とても基本的なことかと思われますが、
 実際にやっていらした事があるかたがいらっしゃいましたら
 是非教えていただきたいです。

 核酸を熱変性させて、冷却し個々に立体構造させたものを
 native-pageでみてみたいのですが
 本来はタンパクーDNAに使用される実験方法かと思っているのですが
 核酸に蛍光をつければ見えたりするものでしょうか?
 
 
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(無題) 削除/引用
No.316-6 - 2012/03/20 (火) 17:06:12 - n
Native PAGEは非変性PAGEのことです。
別にタンパクーDNA複合体を見るためだけの方法ではありません。
核酸の高次構造を見るためにnative PAGEをやるのはよくある一般的な手法です。

もちろん、あなたの複合体がそれで判別できるかはやってみないと分かりません。
泳動温度やゲルや泳動bufferの組成を検討する必要もあるかもしれません。
UV、CD、蛍光など分光学的方法も考慮すべきでしょう。

まずは、似たような論文を探して読んでください。

(無題) 削除/引用
No.316-5 - 2012/03/19 (月) 22:29:30 - pop

詳細を記載しておりませんで申しわけありませんでした。
Native PAGEはDNAとタンパク複合体を電気泳動して、
移動度の差が見えるという実験だと思うのですが、
 
タンパクではなく、普通の低分子化合物(タンパクでもペプチドでもなく)
と核酸を結合したものを電気泳動をしても移動度の差は見えるのでしょう
か?

変性PAGEですと、高次構造による差などが見られないので
 高次構造による差を見る実験方法を探しております。

(無題) 削除/引用
No.316-4 - 2012/03/19 (月) 19:38:49 - ~
http://nar.oxfordjournals.org/content/27/14/2842.full
のようなことをやりたいのでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.316-3 - 2012/03/19 (月) 17:57:34 - sc
SSCPのことでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.316-2 - 2012/03/19 (月) 16:54:24 - ンンノ
「湾曲DNA 構造」とかで検索すると総説が出てきます。

native pageで核酸分離は可能か 削除/引用
No.316-1 - 2012/03/19 (月) 16:35:47 - pop

 いつも大変お世話になっております。
 とても基本的なことかと思われますが、
 実際にやっていらした事があるかたがいらっしゃいましたら
 是非教えていただきたいです。

 核酸を熱変性させて、冷却し個々に立体構造させたものを
 native-pageでみてみたいのですが
 本来はタンパクーDNAに使用される実験方法かと思っているのですが
 核酸に蛍光をつければ見えたりするものでしょうか?
 

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