Bio Technical フォーラム

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転写ついて トピック削除
No.3162-TOPIC - 2014/06/27 (金) 14:31:25 -
現在大学4年です。
実験を行う前に転写開始点を調べろと教授から指示があったのですがどのように調べたらいいのか分かりません(配列など)。
また、酸化ストレスに応答する転写因子でNrf2やNF-KB以外の転写因子が挙げられるか教えてください。
 
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(無題) 削除/引用
No.3162-3 - 2014/06/28 (土) 02:23:16 - おお
>[Re:1] ださんは書きました :
> 現在大学4年です。
> 実験を行う前に転写開始点を調べろと教授から指示があったのですがどのように調べたらいいのか分かりません(配列など)。


ESTなどの解析からゲノムに転写開始位置をアサインしたデーターベースもあるとおもいますが、、、

http://www.ensembl.org/index.html
ここでmRNAがどこから始まっているのか一応わかるようになってはいます。転写開始にdeepに解析しているわけではないとおもいますが。


> また、酸化ストレスに応答する転写因子でNrf2やNF-KB以外の転写因子が挙げられるか教えてください。

これはご自分でお調べになった方が、、、
jnk p38も活性化しますのでその下流も動いてるような気がしますし、NF-KBでなにかほかの転写因子の発現が促進されるならそれも関与しているでしょうし。。。

(無題) 削除/引用
No.3162-2 - 2014/06/27 (金) 20:31:04 - Harmonia
>転写開始点

既知なら論文、未知ならESTとの比較かな。

>酸化ストレスに応答する転写因子

KEGGを使うかな。

転写ついて 削除/引用
No.3162-1 - 2014/06/27 (金) 14:31:25 -
現在大学4年です。
実験を行う前に転写開始点を調べろと教授から指示があったのですがどのように調べたらいいのか分かりません(配列など)。
また、酸化ストレスに応答する転写因子でNrf2やNF-KB以外の転写因子が挙げられるか教えてください。

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