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マイコプラズマ トピック削除
No.3234-TOPIC - 2014/07/24 (木) 04:33:35 - Gachapin
いつも大変参考にさせていただいております

研究室の細胞株20種類をひととおり、マイコプラズマ検出キットで検査しております。

費用の関係から安価なATCCからのキットを使用しております。
PCRによる増幅をかけて検出しますが、相談したいのは
偽陽性 偽陰性の可能性についてです。
偽陰性はPCRがうまくかかっていないとき DNAが抽出できていないとき。
偽陽性は陽性コントロールのコンタミが考えられるのですが、これ以外に偽陰性 偽陽性のおこる機序をおしえていただければ幸いです。
コンタミであれば手技の問題ですし、もしPCRによる偽陽性の可能性があればキットを変えなければならなくなります。
ほかの検出方法のほうがいいのでしょうか。
バンドはちゃんとでてダイマーとは考えにくいのです。
(数年間にはほかの方法で陰性と診断された細胞株もその当時の株を起こして検査すると陽性となってしまったのでこまっています。)
 
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No.3234-7 - 2014/07/24 (木) 22:20:33 - Gachapin
ご意見ありがとうございました。
参考にさせていただきます。

(無題) 削除/引用
No.3234-6 - 2014/07/24 (木) 10:22:07 - おお
>[Re:5] AAさんは書きました :
> 実際にコンタミしているならDAPIなんかの核染色で見ることができると思います。



ご経験のある方にききたいのですが感度的にはPCRとくらべどうなんでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.3234-5 - 2014/07/24 (木) 10:11:32 - AA
実際にコンタミしているならDAPIなんかの核染色で見ることができると思います。

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No.3234-4 - 2014/07/24 (木) 07:54:31 - ぺーぺー
もし、ネガコンにはバンドが出なくて再現がとれているのであれば、その結果を疑う理由がよく分からないです。あと、そんなことやる意味があるのかは知りませんが、バンド切り出してシークエンスすれば原因究明の助けになるかもしれません。偽陰性についてですが、ご指摘の問題は内部標準を置くことで容易に回避可能かと考えます。

(無題) 削除/引用
No.3234-3 - 2014/07/24 (木) 05:55:03 - tatsumi
陰性だと思っていたのに陽性と出てしまったサンプルを一つか二つどこかの業者さんに出して検出してもらってはどうでしょうか?業者さんによってはたくさんの種類のマイコプラズマをスクリーニングしてくれると思うので、Gachapinさんが検出しようとした種類のマイコも入っているのではないでしょうか。その結果とご自身のを合わせれば、手技の問題だったのか元から陽性だったのかわかりますよね。もしくは同じ検査をしているラボにフリーズストック状態の細胞を渡してそちらでテストしてもらうとか。

(無題) 削除/引用
No.3234-2 - 2014/07/24 (木) 05:17:32 - おお
じゃあおそらく陽性なんでしょう。培地の方がコンタミしてた可能性は?

マイコプラズマ 削除/引用
No.3234-1 - 2014/07/24 (木) 04:33:35 - Gachapin
いつも大変参考にさせていただいております

研究室の細胞株20種類をひととおり、マイコプラズマ検出キットで検査しております。

費用の関係から安価なATCCからのキットを使用しております。
PCRによる増幅をかけて検出しますが、相談したいのは
偽陽性 偽陰性の可能性についてです。
偽陰性はPCRがうまくかかっていないとき DNAが抽出できていないとき。
偽陽性は陽性コントロールのコンタミが考えられるのですが、これ以外に偽陰性 偽陽性のおこる機序をおしえていただければ幸いです。
コンタミであれば手技の問題ですし、もしPCRによる偽陽性の可能性があればキットを変えなければならなくなります。
ほかの検出方法のほうがいいのでしょうか。
バンドはちゃんとでてダイマーとは考えにくいのです。
(数年間にはほかの方法で陰性と診断された細胞株もその当時の株を起こして検査すると陽性となってしまったのでこまっています。)

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