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(無題) 削除/引用 No.3366-6 - 2014/09/16 (火) 09:42:34 - GLUT4 http://mirdb.org/miRDB/index.html

ありがとうございます 削除/引用 No.3366-5 - 2014/09/12 (金) 22:35:48 - a ご紹介いただいたサイトですが， http://deepbase.sysu.edu.cn/chipbase/tfmiRtargetNetworks.php は目的の転写因子が含まれておらず， http://www.microrna.org/microrna/home.do は転写因子側から制御されるmicroRNAは探せるものの 転写因子のターゲットとなるmicroRNAは探せないようです。 TRANSFACは購入しないと使えないようですし，今回の用途にあっているか不明でした。 なにかほかのサイトなどご存知の方いらっしゃいましたらご教授お願いします。

ありがとうございます。 削除/引用 No.3366-4 - 2014/09/12 (金) 22:32:59 - a

(無題) 削除/引用 No.3366-3 - 2014/09/11 (木) 07:50:30 - col http://www.microrna.org/microrna/home.do 転写因子側からも、マイクロRNA側からも探せると思います。 SVRスコアなる確実性スコアも調べられます。

(無題) 削除/引用 No.3366-2 - 2014/09/11 (木) 05:20:32 - おお http://deepbase.sysu.edu.cn/chipbase/tfmiRtargetNetworks.php ちょっと見にくいですが、これはTFからのmiRNAも含まれているようですが、、、どの程度のクオリティのoutputかわかりませんけど。 TRANSFACはChipデーターなど統合しているようなので、結合部位から割り出しができる可能性はありますが、、、商品化されていてfreeで使えるものは制限されているようですね。。。

mir データベース 削除/引用 No.3366-1 - 2014/09/10 (水) 21:10:57 - a mirに精通した方がいましたら教えてください。 mirのターゲット遺伝子を推定するデータベース・サイトはいくつかあると思いますが， 逆にある転写因子などのターゲットになるmirを探すデータベース・サイト・ツールはありますでしょうか？ よろしくお願いします。

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