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ウェスタン泳動の泳動トラブル(BPBが泳動中に黄色へ変わる) トピック削除
No.3462-TOPIC - 2014/10/16 (木) 07:36:25 - 初心者
ウェスタンが最近突然うまくいかなくなりました。

泳動する際、通常BPBの青い線が一直線上に並ぶと思うのですが、
ある日突然、いくつかあるメンブレンのサンプルの中央レーンがセパレーティングゲルに入ると、
黄色になって泳動されるようになりました。
(それでも普通にシグナルの検出はできていますがとても気持ち悪いです。)

ちなみにすべて同じサンプルを泳動しても中央付近のレーンだけ黄色く泳動されるので、
中央付近のサンプルのphがおかしいこともありません。

ゲルの組成にムラができるようになったのでしょうか?
それとも泳動装置に問題があるのでしょうか?

もし原因がおわかりの方がおりましたら、おしえていただけないでしょうか?
よろしく御願いいたします。
 
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(無題) 削除/引用
No.3462-7 - 2014/10/16 (木) 18:58:34 - qw
一度、市販品に全て置き換えてみると良いかもしれません。そのような決定をあなたが出来ないのであれば、自分で作成しているものは何なのかを明かにすると
解決策があるかもしれません。
質問文の以下の部分がまったく想像できません。(他の方は解るのかなあ?)
>いくつかあるメンブレンのサンプルの中央レーンがセパレーティングゲルに入ると、

「メンブレン」は、何の事なのでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.3462-5 - 2014/10/16 (木) 14:57:25 - しろ
黄色になる位置が毎回違うならゲル内のpHが均一じゃないとか考えられるけど、中央部分だけ毎回となると電気泳動のハード的な問題では
電気泳動中にバッファーのpHも変わるだろうしゲルも縮むだろうから
ゲル版の中央あたりがわずかに曲がってるか何かで隙間が出来てゲルと酸性に傾いたバッファーが直接触れてしまったとかどうだろう

(無題) 削除/引用
No.3462-4 - 2014/10/16 (木) 10:39:21 - AP
今回がそうであるかどうかはおいて、よくありがちな失敗としては、
1. 泳動バッファーを作ってみたら、pHがずれていたので塩酸で調整した。正しい試薬でレシピどおりに作ればpHはあっているはず。ずれていたら何か間違っているので、塩酸等で調整せずつくり直す。

2. free-baseのTrisではなくTris塩酸塩を使った。

(無題) 削除/引用
No.3462-3 - 2014/10/16 (木) 09:35:01 - おお
げんいんはちょっとよくわからないですが BPBはpH指示薬にも使われていて黄色になるということはpHが酸性にかたよってます。えいどうそうやゲルのバッファーが古くなってきているとか、そんなにえいどうには影響がない範囲ですこし何かが多めに入ってるとか、、、電流や電圧は正常でしょうか?

(無題) 削除/引用
No.3462-2 - 2014/10/16 (木) 09:29:13 - ごんべえ
pHが酸性になると黄色くなります。
ためしにBPBに希塩酸ぶちこんでみてください。

ウェスタン泳動の泳動トラブル(BPBが泳動中に黄色へ変わる) 削除/引用
No.3462-1 - 2014/10/16 (木) 07:36:25 - 初心者
ウェスタンが最近突然うまくいかなくなりました。

泳動する際、通常BPBの青い線が一直線上に並ぶと思うのですが、
ある日突然、いくつかあるメンブレンのサンプルの中央レーンがセパレーティングゲルに入ると、
黄色になって泳動されるようになりました。
(それでも普通にシグナルの検出はできていますがとても気持ち悪いです。)

ちなみにすべて同じサンプルを泳動しても中央付近のレーンだけ黄色く泳動されるので、
中央付近のサンプルのphがおかしいこともありません。

ゲルの組成にムラができるようになったのでしょうか?
それとも泳動装置に問題があるのでしょうか?

もし原因がおわかりの方がおりましたら、おしえていただけないでしょうか?
よろしく御願いいたします。

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