Bio Technical フォーラム

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点変異の検出 トピック削除
No.360-TOPIC - 2012/04/03 (火) 13:29:39 - Harrison
ある腫瘍の研究をしています。あるエクソンにのみ効率的に変異が起こる腫瘍の調査をしています。
変異はdeletion, insertion, point mutationと様々です。deletionやinsertion変異を検出するのは、PCRの断片長を比較するだけで容易にサーベイできるのですが、点変異の検出に頭を悩ませています。配列を読めばわかるのですが、スクリーニング的な意味合いの検出ができないだろうか、と考えています。サイクレン混合するPCRなどあるようですが、他にもヒントになるような方法が有りましたらご教授頂きたいと思います。　よろしくお願いいたします。
　
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(無題) 削除/引用
No.360-4 - 2012/04/03 (火) 18:56:09 - a
SSCP

(無題) 削除/引用
No.360-3 - 2012/04/03 (火) 15:54:47 - AP
SURVEYOR Nuclease Kits
http://www.transgenomic.com/pd/surveyor/surveyor.asp

PCR産物のheteroduplex（野生型vs変異型）を作り、ミスマッチを認識して二重鎖切断する酵素（CelI）を作用させて、切断の有無で点突然変異や小さな欠失挿入を検出します。

点変異の検出 削除/引用
No.360-1 - 2012/04/03 (火) 13:29:39 - Harrison
ある腫瘍の研究をしています。あるエクソンにのみ効率的に変異が起こる腫瘍の調査をしています。
変異はdeletion, insertion, point mutationと様々です。deletionやinsertion変異を検出するのは、PCRの断片長を比較するだけで容易にサーベイできるのですが、点変異の検出に頭を悩ませています。配列を読めばわかるのですが、スクリーニング的な意味合いの検出ができないだろうか、と考えています。サイクレン混合するPCRなどあるようですが、他にもヒントになるような方法が有りましたらご教授頂きたいと思います。　よろしくお願いいたします。
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