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Dynabeads M-270 Carboxylic Acid トピック削除
No.3743-TOPIC - 2015/01/14 (水) 06:17:57 - けつごう
お世話になっています。
M-270 Carboxylic Acidについて質問があります。

この製品はDNAの精製用にも使えると記載があります。
また、昔にどこかの研究室がPCR後の精製に使っているとの話も聞いた気がします。

どなたか、ラボでこの製品をPCR精製に使っているまたはいた方はいらっしゃらないでしょうか？もしよければプロトコールを教えて頂けると嬉しいです。よろしくお願いします。
　
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No.3743-8 - 2015/01/15 (木) 09:06:30 - ss
オリジナルを見た限り、塩濃度とPEGの添加が重要なようですので、自作する際は注意が必要ですね。
結合様式は詳しく調べてませんが、塩濃度を上げてPEGを入れることから疎水性相互作用を利用しているのかと。

(無題) 削除/引用
No.3743-7 - 2015/01/15 (木) 02:21:19 - おお
勉強になりました。なんで-COOHがDNAなどにつくんでしょうかね。シリカとおんなじようなかんじなんでしょうかねぇ

(無題) 削除/引用
No.3743-6 - 2015/01/15 (木) 01:21:00 - けつごう
>>おおさん

違いますね・・・。

>ssさん
素晴らしいヒントでした！ありがとうございます。AMPureのビーズをM-270 Carboxylic Acidで置き換えた使い方でした。これでやっと自作出来ます。感謝です。

(無題) 削除/引用
No.3743-5 - 2015/01/14 (水) 13:01:24 - ss
SPRI法で調べてみては？

(無題) 削除/引用
No.3743-4 - 2015/01/14 (水) 09:09:02 - おお
ttps://www.lifetechnologies.com/order/catalog/product/37002D
もしかしたらM-270 Carboxylic Acidでなくってこちらじゃないでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.3743-3 - 2015/01/14 (水) 07:16:58 - けつごう
そのような使い方ではなかったですね。
単純にPCR反応後の溶液と混合して磁石で回収、85% EtOHで洗浄
ドライ、Elution Buffer(Qiagenの残り)で溶出というのは覚えているんです。

ただ誰から聞いたのか・・・。

ありがとうございます。

(無題) 削除/引用
No.3743-2 - 2015/01/14 (水) 07:11:38 - おお
ttp://www.b2b.invitrogen.com/site/us/en/home/Products-and-Services/Applications/Clinical-and-Diagnostic-Applications/Bead-based-IVD-Assays/Bead-based-Nucleic-Acid-IVD.html

immobilization of amino-modified oligonucleotides, antibodies or other ligands, for capture of specific DNA/RNA sequences, proteins or any other analyte

ってかいてるよ。アミノ基をつけたDNAやRNAを化学反応でビーズにコバレントにつけて、oligodTのビーズのようにアニーリングを利用して配列特異的なDNA/RNAを拾うのはできるなぁ。。。

目的はなんですか?

Dynabeads M-270 Carboxylic Acid 削除/引用
No.3743-1 - 2015/01/14 (水) 06:17:57 - けつごう
お世話になっています。
M-270 Carboxylic Acidについて質問があります。

この製品はDNAの精製用にも使えると記載があります。
また、昔にどこかの研究室がPCR後の精製に使っているとの話も聞いた気がします。

どなたか、ラボでこの製品をPCR精製に使っているまたはいた方はいらっしゃらないでしょうか？もしよければプロトコールを教えて頂けると嬉しいです。よろしくお願いします。
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