Bio Technical フォーラム

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リアルタイムPCRの表し方 トピック削除
No.3821-TOPIC - 2015/02/06 (金) 13:16:00 - pipi
リアルタイムPCRで遺伝子の発現を定量しています。
卒論で図にまとめているのですが、縦軸はコピー数(目的遺伝子のコピー数をハウスキーピング遺伝子であるGAPDHのコピー数で補正したもの)で表しています。
ハウスキーピング遺伝子で補正する意味は先生からの説明で理解できたのですが、なぜそもそも縦軸をコピー数にするのか分かりません。
説明せれましたが、うまく理解できませんでした。
縦軸をコピー数以外で表す場合もあるのでしょうか?
また、コピー数でとるのが主流なのでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.3821-3 - 2015/02/06 (金) 15:09:32 - おお
その実験の目的は何で、何を見たかったんですか?それでそれをグラフにどの様に表現できますか?

(無題) 削除/引用
No.3821-2 - 2015/02/06 (金) 14:18:59 - qw
>なぜそもそも縦軸をコピー数にするのか分かりません。
あなただったら縦軸の単位を何で表せばしっくりくると思うのですか?
まずはそこから提示していただきたいです。

>ハウスキーピング遺伝子であるGAPDHのコピー数で補正したもの
改めて考えると、GAPDHのコピー数は求めることができるとして、その値で目的遺伝子のコピー数を補正できるものだろうか?

リアルタイムPCRの表し方 削除/引用
No.3821-1 - 2015/02/06 (金) 13:16:00 - pipi
リアルタイムPCRで遺伝子の発現を定量しています。
卒論で図にまとめているのですが、縦軸はコピー数(目的遺伝子のコピー数をハウスキーピング遺伝子であるGAPDHのコピー数で補正したもの)で表しています。
ハウスキーピング遺伝子で補正する意味は先生からの説明で理解できたのですが、なぜそもそも縦軸をコピー数にするのか分かりません。
説明せれましたが、うまく理解できませんでした。
縦軸をコピー数以外で表す場合もあるのでしょうか?
また、コピー数でとるのが主流なのでしょうか?

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