Bio Technical フォーラム

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統計解析の仕方について トピック削除
No.4076-TOPIC - 2015/05/06 (水) 20:39:27 - Rob
共同研究者から、人の腫瘍から樹立された3種類の乳癌細胞株を貰いました。一つはそのまま継代したもの、他二つはアドレアマイシンおよびプラチナ系抗がん剤に対して抵抗性を持ったものです。これら3種の遺伝子発現やタンパク質発現に差があるかどうか確認したいのですが、この場合N数は1になると思いますので統計解析の仕方に悩んでいます。

non-treated, アドレアマイシン抵抗性株, 白金製剤抵抗性株の3種からタンパク質抽出やRNA調製を3度繰り返し、 一つの実験として統計解析をしようと思っていますが、手元にある材料での統計解析には問題無いかと思いますが、見ている事象が本当に薬剤抵抗性を獲得したからなのかどうなのかまでは言及できないと思っています。論文に載せるためのデータとしてどのように扱ったらよろしいでしょうか?N=3だけれど、サンプルの元手は同じもの、と記載すればいいのでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.4076-3 - 2015/05/11 (月) 12:51:16 - qw
このような実験をやったことがあるわけではないのですが、
non-treatedは、親株ですよね。
親株からランダムに生成したサブクローンを可能な範囲で増やすと、親株のそれぞれの遺伝子発現の分散のようなものが出るだろうと思います。
そこから個々の遺伝子発現量の95%CIが算定可能でしょうから、あなたの耐性株の遺伝子発現が十分離れているとか、誤差の範囲内であると言ったような提示ができるのではないかと思います。

(無題) 削除/引用
No.4076-2 - 2015/05/06 (水) 21:45:11 - おお
そのcell lineで三回実験を繰り返したと書けばいいです。そうすることで、その細胞間での遺伝子や蛋白の差は再現性があり有意に差があるといえることがしめせます。

もちろん薬剤耐性がその遺伝子なり蛋白の発現に影響したかどうかはその実験だけでは、可能性を提示しただけで言い切るには及びません。

細胞がほかにないなら、違う角度からの実験などで検証していくのも方法論だと思います。

統計解析の仕方について 削除/引用
No.4076-1 - 2015/05/06 (水) 20:39:27 - Rob
共同研究者から、人の腫瘍から樹立された3種類の乳癌細胞株を貰いました。一つはそのまま継代したもの、他二つはアドレアマイシンおよびプラチナ系抗がん剤に対して抵抗性を持ったものです。これら3種の遺伝子発現やタンパク質発現に差があるかどうか確認したいのですが、この場合N数は1になると思いますので統計解析の仕方に悩んでいます。

non-treated, アドレアマイシン抵抗性株, 白金製剤抵抗性株の3種からタンパク質抽出やRNA調製を3度繰り返し、 一つの実験として統計解析をしようと思っていますが、手元にある材料での統計解析には問題無いかと思いますが、見ている事象が本当に薬剤抵抗性を獲得したからなのかどうなのかまでは言及できないと思っています。論文に載せるためのデータとしてどのように扱ったらよろしいでしょうか?N=3だけれど、サンプルの元手は同じもの、と記載すればいいのでしょうか?

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