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(無題) 削除/引用 No.4186-5 - 2015/06/16 (火) 08:01:27 - GE 皆さま アドバイスありがとうございます。 酵素消化とエタ沈があるのですね。 酵素消化については、調べてみます。

(無題) 削除/引用 No.4186-4 - 2015/06/16 (火) 00:31:29 - おお 酵素だとt7 dna polymeraseと十分なdNTPを添加して数分incubationすると、アニーリングするべきところがないsingle strand は消化されてしまいます。

(無題) 削除/引用 No.4186-3 - 2015/06/16 (火) 00:27:32 - おお サイズでわけるのが一番いいかと思いますが、ただゲノムはでっかくて扱いにくいし、PCRレベルで引っかからないように除くというのはけっこう大変かもしれません。 クラッシックな方法で、エタチンなんですが、繊維状に析出してくるゲノムDNAをパスツールのようなガラスで巻きとるほうほうがあります。そうするとRNAや夾雑物の蛋白の沈殿を除くことができるそうですが、PCRで引っかからなくなるほど完璧な方法かどうかわかりません。 あとなるべくゲノムを傷つけないようにポアの比較的大きな限外濾過膜でガンガン洗う方法がありますけど。

(無題) 削除/引用 No.4186-2 - 2015/06/15 (月) 23:46:51 - enen オリゴDNAが1本鎖なら、S1 nucleaseやMung bean nucleaseで消化。

genome DNAから９０base断片の除去 削除/引用 No.4186-1 - 2015/06/15 (月) 22:57:45 - GE 精製したgenome DNAを用いてPCRをしています。 実験のステップで、誤ってこのgenome DNAに90 baseのオリゴDNAをコンタミさせてしまいました。90baseのオリゴが、PCRの際に目的のPCR産物と類似分子量のPCR産物発生の原因となって困っています。 genome DNAは特別なものであり、すぐに取り直すことができません。 そこで、90 baseのオリゴDNAをgenome DNAから除去したいのですが、良い方法（キットなど）をご存じないでしょうか？ よろしくお願いします。

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