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腫瘍のクローナル解析について トピック削除
No.4634-TOPIC - 2015/12/04 (金) 12:37:27 - a
お世話になります。

一臨床医として皆さまからのアイディアをいただきたく存じます。

原発とは異なる部位に腫瘍が存在する場合に,このふたつの腫瘍のクローナリティーを調べる方法はなにかありますでしょうか?

具体的には,骨盤内の原発の腫瘍と腹膜の腫瘍があった際に,このふたつが原発が二つか,骨盤から腹膜への転移かを調べる方法を探しています。

このふたつの腫瘍をlaserなどで腫瘍細胞を切り取り,比較したいと考えました。

なにか妙案ありましたらご教授お願いいたします。

可能な限り簡便な方法が望ましいです。
 
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(無題) 削除/引用
No.4634-3 - 2015/12/04 (金) 16:32:46 - mon
おおさんの意見と同じですが、
(1)変異がある遺伝子が判っていれば塩基配列を比較するのが直接的でしょうが(力業も出来なくはないですが)、現実的ではなさそう。
(2)LOHを原発癌特異的に検出できるPCRとか(これもLOHを探さなくてはいけない)
(3)複数箇所のマイクロサテライトの反復数を比較する(PCR)
(4)ゲノムワイドのDNAアレイ検査、でしょうか。
(3)に関しては、特徴的なマイクロサテライトが見つかれば判定は容易ですが、そうでない場合は、癌が進行すると反復数が変化するので、あくまでも複数のパターンを比べるということになるかと思います。
参考にならないかもしれませんが、
Shibata D. et al. Somatic microsatellite mutations as molecular tumor clocks. Nature Medicine 6:676-681(1996)
クローナリティーについて他の論文があったような記憶があるのですが。。。

(無題) 削除/引用
No.4634-2 - 2015/12/04 (金) 12:48:08 - おお
ゲノムの変異のパターンなどでかなり分かりそうな気がしますけど。。。だめかな。

腫瘍のクローナル解析について 削除/引用
No.4634-1 - 2015/12/04 (金) 12:37:27 - a
お世話になります。

一臨床医として皆さまからのアイディアをいただきたく存じます。

原発とは異なる部位に腫瘍が存在する場合に,このふたつの腫瘍のクローナリティーを調べる方法はなにかありますでしょうか?

具体的には,骨盤内の原発の腫瘍と腹膜の腫瘍があった際に,このふたつが原発が二つか,骨盤から腹膜への転移かを調べる方法を探しています。

このふたつの腫瘍をlaserなどで腫瘍細胞を切り取り,比較したいと考えました。

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