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発現レベルの高いアイソフォームの検索方法 トピック削除
No.4680-TOPIC - 2015/12/18 (金) 03:35:52 - Houston
癌細胞のmigration/invasionに関して研究しているものです。
現在ある遺伝子に着目して、その機能解析(遊走・浸潤能)をin vitroで行っています。siRNAを用いてKDの実験は終了したのですが、次に発現プラスミドを用いて過剰発現系での実験を行いたいと思っています。
ただ、この遺伝子は余り知られていない遺伝子なのですが、多数のアイソフォームが存在していることが知られています。過剰発現するさいに、出来れば最もその組織において発現量の多い(もしくは最も機能的な)アイソフォームを過剰発現させたいと思っているのですが、これを知るにはどのような方法が考えられるでしょうか。
また、もし遺伝子毎にアイソフォームの発現量・機能について検索できるようなツールをご存じの方がおられましたら、教えて頂けますでしょうか。
よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.4680-3 - 2015/12/18 (金) 09:55:53 - み
ところで最も発現量が多いアイソフォームがその現象に効いている保証はあるのでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.4680-2 - 2015/12/18 (金) 03:55:57 - おお
もしその様なデーターが世の中にないのならqPCRとかして、キャラクタライズすればどうですか。そう言うのも有用な情報だし論文に同時に載せると評価が上がります。そのまえにそのsiRNAはすべてのアイソフォームがKDできるようになっていますか?
それでそれで除外できるものがあれば見るべきものがへりますので。

発現レベルの高いアイソフォームの検索方法 削除/引用
No.4680-1 - 2015/12/18 (金) 03:35:52 - Houston
癌細胞のmigration/invasionに関して研究しているものです。
現在ある遺伝子に着目して、その機能解析(遊走・浸潤能)をin vitroで行っています。siRNAを用いてKDの実験は終了したのですが、次に発現プラスミドを用いて過剰発現系での実験を行いたいと思っています。
ただ、この遺伝子は余り知られていない遺伝子なのですが、多数のアイソフォームが存在していることが知られています。過剰発現するさいに、出来れば最もその組織において発現量の多い(もしくは最も機能的な)アイソフォームを過剰発現させたいと思っているのですが、これを知るにはどのような方法が考えられるでしょうか。
また、もし遺伝子毎にアイソフォームの発現量・機能について検索できるようなツールをご存じの方がおられましたら、教えて頂けますでしょうか。
よろしくお願いします。

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