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(無題) 削除/引用 No.4683-4 - 2015/12/20 (日) 02:08:22 - cmv おお様 Primer extension という方法があるのですね。 知りませんでした。 これなら簡単に転写開始点を知ることができそうです。 有難うございます！ しかしCMVのような有名なプロモーターでも転写開始点はあやふやなんですね。

(無題) 削除/引用 No.4683-3 - 2015/12/19 (土) 14:23:55 - おお 示された文献は未だ見てないていたらくな回答者ですけど、RACEよりもprimer extentionだけで解決するかと思いますけどね。まあシーケンスグレードのPAGEとか感度に寄ってはRIがいりますけどね。 非常にラフにやるならRTPCRでどの領域までPCRがかかるかとかでも大体の場所は絞れる可能性は高いのでは？

(無題) 削除/引用 No.4683-2 - 2015/12/19 (土) 10:59:06 - おお 証明にはならないかもしれませんけど、transcription start siteのpredictionなどもできるようになっているのではとおもいます。 ヒストンの配置のされ方などでもかわってくるのかなぁ。。。

CMVプロモーターの転写開始点 削除/引用 No.4683-1 - 2015/12/19 (土) 08:33:03 - cmv いつも勉強させていただいております。 この度CMVプロモーターの転写開始点に関して質問させて頂きます。 現在プロモーターのどの領域から転写が開始するかを調べているのですが文献により転写開始点がそれぞれ異なりどれが本当なのかと思っております。 例えば Cellular or Viral Protein Binding to a Cytomegalovirus Promoter Transcription Initiation Site: Effects on Transcription Modulating ectopic gene expression levels by using retroviral vectors equipped with synthetic promoters CMV promoter is repressed by p53 and activated by JNK pathway これらの論文で開始点が異なります。 最初の論文はしっかりと研究されており、かつJVですので信用できると思っているのですが。自身が持っているプラスミドを発現させ5'RACEをやるというのも一つの手ですが。 どなたか詳しい方がおりましたらご教授お願い致します。

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