全3件 ( 1 〜 3 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

(無題) 削除/引用 No.4994-3 - 2016/04/16 (土) 15:47:56 - AP Like thes: https://www.google.co.jp/search?q=snp+sequence&safe=off&hl=ja&source=lnms&tbm=isch&sa=X&ved=0ahUKEwiv4Ovkw5LMAhXLoJQKHTyRCoUQ_AUIBygB&biw=1079&bih=608#safe=off&hl=ja&tbm=isch&q=snp+sequence+electropherogram 波形が全く重なったとしても、波長ごとに検出されているので見間違うことはありません。また波形データを直接取り込んでbese callしたうえSNPを検出するソフトもいろいろ有ります（例えばhttp://www.molgen.ua.ac.be/bioinfo/novosnp/）。おおよそ、SNPの頻度が20:1くらいでも（ヘテロ接合のように1:1でなくても）検知可能だそうです。 A or Gのような場合、A/Gのように配列上の表記がされることが多いように思いますが、IUPACに従い、S (Strong: C/G), W (Weak: A/T), K (Keto: G, T), M (aMino: A/C), R (puRine: A/G); Y (pYrimidine; C, T); B (not A: C/G/T), D (not C: A/G/T), H (not G: A/C/T), V (not T: A/C/G), N (aNy: A/C/G/T)のように一文字で表すのが便利な場合もあります。

(無題) 削除/引用 No.4994-2 - 2016/04/16 (土) 14:59:10 - 小児科医師（ゆとり教育） DNAシーケンスの波形を見ると二つのピークが見えると思います。ピークが全く重なることもまれにはありますが、基本的には高さが異なるので見分けることができます。

サンガー方にシーケンスのデータの読み方 ヘテロとホモ 削除/引用 No.4994-1 - 2016/04/16 (土) 13:44:38 - たけ お世話になります。大学院にて遺伝子変異の検出を始めたばかりの初心者です。 サンガー法では塩基配列を決定しますが、この時、母親由来染色体上のある一塩基がaで.父親由来で同じ染色体の同じ場所のある一塩基がgのように、母親由来染色体と父親由来の染色体の同場所で塩基が違う場所が存在するかと思います。この場合、サンガー法での塩基配列決定時に表示される波形はどのような波形になるのでしょうか？aとgのピーク値が重なったような波形になるのでしょうか？またこの場合、当確塩基配列の部位はa or gのように、aもgもあり得るというように論文で発表されるのでしょうか？

全3件 ( 1 〜 3 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

パスワードを入力してチェックした記事を

チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する 名前  メール  　アドレス非公開    タイトル  本文       設定  クッキーを保存（次回の入力の手間を省けます） 上に上げない（トピックの一覧で一番上に移動させません） 解決（問題が解決した際にチェックしてください） 暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。 送信

---

〔使い方〕 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。

---