Bio Technical フォーラム

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RNA抽出 トピック削除
No.5222-TOPIC - 2016/07/08 (金) 08:02:21 - yukiyama
マウスの内耳組織(骨に囲まれた中に軟部組織が入っている)
からRNAeasyでRNA抽出をしています。
RIN8以上のものがとれていたのですが、品質が不安定になり
(悪い時は4台)こまっています。

1)RNAlater中で組織を切り出し。即座に液体窒素で凍結保存。
 骨ごとホモジナイズしてRNA抽出。
の手順でやっているのですが、凍結組織を輸送したりしているので、保存方法に問題があり不安定になっているのかと思い

2)RNAlater中で組織を切り出し。RNAlater中で4度で一晩インキュベートしてRNAlaterを浸透させてから低温で保存。骨ごとホモジナイズしてRNA抽出。

としてみようかと思うのですが、そもそもホモジナイズし難い組織なのが問題なのかと思ったりもします。

どなたかお考えはありませんでしょうか?
何卒よろしくお願いします。
 
 
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(無題) 削除/引用
No.5222-3 - 2016/07/08 (金) 12:03:30 - seventh
その場でホモジナイズできるならbufferRLTなどのグアニジン系変性剤の入った溶液でホモジナイズしたほうが良いです。この状態でも冷凍保存出来ます。

RNlaterの浸透性を高めるために、組織を今より小さく分けるのも効果があるかもしれません。

できれば当日 削除/引用
No.5222-2 - 2016/07/08 (金) 10:54:22 - ema
骨のRNAの場合ですが、たくさんの個体を取りたかったときに次の日にしたことがあり、組織をちゃんと粉砕して(クールミル)N2凍結
http://www.tokken.jp/products/breaker/coolmill.html
Trizolに入れて当日数検体と次の日数検体取ったものでは品質の差が出ました。
微妙な夾雑物がRNAの分解促進に働いているのだと思いますので、可能なら(輸送は仕方ないのかもしれませんが)当日中に精製をお勧めします。

RNA抽出 削除/引用
No.5222-1 - 2016/07/08 (金) 08:02:21 - yukiyama
マウスの内耳組織(骨に囲まれた中に軟部組織が入っている)
からRNAeasyでRNA抽出をしています。
RIN8以上のものがとれていたのですが、品質が不安定になり
(悪い時は4台)こまっています。

1)RNAlater中で組織を切り出し。即座に液体窒素で凍結保存。
 骨ごとホモジナイズしてRNA抽出。
の手順でやっているのですが、凍結組織を輸送したりしているので、保存方法に問題があり不安定になっているのかと思い

2)RNAlater中で組織を切り出し。RNAlater中で4度で一晩インキュベートしてRNAlaterを浸透させてから低温で保存。骨ごとホモジナイズしてRNA抽出。

としてみようかと思うのですが、そもそもホモジナイズし難い組織なのが問題なのかと思ったりもします。

どなたかお考えはありませんでしょうか?
何卒よろしくお願いします。
 

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