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p-IκBαの分解について トピック削除
No.5445-TOPIC - 2016/10/04 (火) 19:15:23 - rinsanka
論文を読んでいて、p-IκBαの分解について疑問が浮かんだので質問させてください。

専門ではないので間違っているかもしれないのですが、
NF-κBはIκBと複合体を作って、IκBαのリン酸化を引き金として分解されることによって活性化される
と理解しております。

リン酸化したIκBαが分解されてしまうのなら、ウエスタンなどでp-IκBαを調べることは不可能または無意味ではないのでしょうか。
分解されるのに時間がかかる、もしくは分解される前に見てるってことでしょうか。

論文でもIκBα及びp-IκBαを見ている方はわりと多いので気になりました。
気になってもやもやしているので、教えていただければ嬉しいです。
 
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(無題) 解決済み 削除/引用
No.5445-6 - 2016/10/05 (水) 11:11:58 - rinsanka
monさん

確かに、gel retardation assayがよく出てきますね。
教えていただきありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.5445-5 - 2016/10/05 (水) 08:13:43 - mon
>[Re:3] rinsankaさんは書きました :
> 常に分解されているであろうIkBaの量や分解速度は一定だと考えて比較しているかどうか、ということです。

ほとんどの論文の実験の目的はp-IkBの方ではない(どちらかというとIkB)ので、上記のことは気にしていないと思います。つまりNkBの活性化の指標の一つしてIkBの減少=p-IkBの増加を観ていると思います。
別の指標として(proteasome inhibitorなしで)gel retardation assayも同時に観ていませんか

(無題) 削除/引用
No.5445-3 - 2016/10/04 (火) 21:15:05 - rinsanka
ほんとさん

すみません、私の文章がわかりにくかったですね。
実験の間に分解されてしまうpIkBaはインビビターで防げると思います。

例えばCtrlと、IkBaのDegraduationを抑制する薬剤Aをかけたものを比較したいときに、
常に分解されているであろうIkBaの量や分解速度は一定だと考えて比較しているかどうか、ということです。

(無題) 削除/引用
No.5445-2 - 2016/10/04 (火) 19:26:35 - ほんと
Proteasome inhibitor存在下で見ていると思いますよ。

p-IκBαの分解について 削除/引用
No.5445-1 - 2016/10/04 (火) 19:15:23 - rinsanka
論文を読んでいて、p-IκBαの分解について疑問が浮かんだので質問させてください。

専門ではないので間違っているかもしれないのですが、
NF-κBはIκBと複合体を作って、IκBαのリン酸化を引き金として分解されることによって活性化される
と理解しております。

リン酸化したIκBαが分解されてしまうのなら、ウエスタンなどでp-IκBαを調べることは不可能または無意味ではないのでしょうか。
分解されるのに時間がかかる、もしくは分解される前に見てるってことでしょうか。

論文でもIκBα及びp-IκBαを見ている方はわりと多いので気になりました。
気になってもやもやしているので、教えていただければ嬉しいです。

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