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(無題) 削除/引用 No.5548-2 - 2016/11/12 (土) 13:50:11 - CD ある配列にくっつく転写因子を網羅的に調べたいってことでしょうか？ Reverse ChIPなどは候補だと思いますが、そもそもChIP出来ないような細胞数でMSすることに障害がありそうですね・・・ 細胞数が確保できない実験では最終的にPCR出来る点でタンパク質の解析よりも塩基配列の解析のほうが有利に思います。 でも、候補タンパクも何もない状態でChIPするわけにも行かないですしねえ。培養して増やせる細胞なら（そして性格が保たれているなら）増やしてReverse ChIPがかっこいいかなと思いました。

目的配列の網羅的なエピゲノム解析 削除/引用 No.5548-1 - 2016/11/12 (土) 12:04:16 - su 初めて質問させていただきます。 現在、ヒトのある初代細胞の、ある特異的な配列のエピゲノム解析をしたいと考えております。 方法論としては、ChIPやChIP-seqなどが該当するかと思います。しかしながら、今回対象としている初代細胞の量が微量であること、また、全ゲノム配列を対象としている訳ではなく、対象とする配列がすでに絞られていることから、より適切な解析方法がないかと考えております。 イメージとしては、ChIPの逆のアプローチ、つまり、対象とする配列のみをpull-downし、そこに結合しているタンパク質を網羅的に解析する、というような方法があればと考えているのですが、そのような方法をご存知の方がいらっしゃいましたら、教えていただけたらと思い、質問させていただきました。 どうぞよろしくお願いいたします。

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