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Sepharoseとアガロース トピック削除
No.568-TOPIC - 2012/05/26 (土) 14:30:48 - Dakogilent
 Sepharoseとアガロースは同一ですか?別物ですか?

Sepharoseはかのメーカーが呼んでいるアガロース担体の商標なので、
同一のものだと考えていました。
それともアガロースに特別な処理を施しているものなのでしょうか?

 ご存知の方、教えていただけないでしょうか。よろしくお願いします。
 
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もち様ありがとうございます 削除/引用
No.568-14 - 2012/05/30 (水) 23:28:43 - Dakogilent
ありがとうございます。当方も全く同一だ!とは考えているわけでもなく、先にも書きましたように
>それとも純度(電荷)、形状(球状、架橋の程度)以外でも何か工夫してい>るかどうかが、私の質問の本質のようです。
ということが、質問事項の本質のようです。(皆様とのやり取りの中で、私の質問事項が洗練されてきて良かったと感謝しております。)

例えば、もち様コメントの揚げ足を取るような返信をするとなれば、
核酸電気泳動用のアガロースにおいても、核酸サイズに応じたアガロースの使い分けや、ゲル融点の違いなど、各々アガロースの物性に応じた違いが存在します。

 自分の書いた文章を読み返すと、セファロース=アガロースに固執している感も出ており、書き方が拙かったかなと反省もしております。決して意固地になっている訳ではありませんので、いろいろな方と意見を交わせれば良いなと考えております。

(無題) 削除/引用
No.568-13 - 2012/05/30 (水) 05:40:14 - もち
アガロースを原料として、厳密にコントロールされた条件で加工製造された、ポリアガロース微粒子
よって、ケミカルな組成はよく似ていても、物性は全然違う

もち米ともち、○○屋のと指定付きのもち、食べたら違いがわかるはず

本人も脱線しますが 解決済み 削除/引用
No.568-12 - 2012/05/29 (火) 21:44:16 - Dakogilent
Ni-NTA-SuperflowやTALON Superflow などの Superflow もアガロースでいいですよね・・・・・なんてね
http://www.sterogene.com/crosslinkedparticles.html

 まー、SepharoseもSuperflowも厳密にコントロールされたアガロースということで一度解決にしたいと思います。コメントを頂いた皆様、ありがとうございました。(いやいや大きな違いがあって区別するべきだ!というコメントがありましたら、どしどし意見いただけますれば幸いです)

脱線しますが 削除/引用
No.568-11 - 2012/05/29 (火) 20:28:35 - こうじ
Sepharoseは、アマシャムに吸収されたファルマシアの商標で
Separation Pharmacia Agarose
から取られています。
そのネーミングには元があり、
Separation Pharmacia DextranでSephadexと名付けられた経緯があります。

(無題) 削除/引用
No.568-10 - 2012/05/28 (月) 21:24:11 - ンンノ
なんかトリビアな感じですが、

セファロースはカラムクロマトグラフィー用に開発された製品で、それを単に
球状アガロースビーズと言ってしまっていいかどうかということですが...

セファロースという製品は、サイズや形がキレイに揃っているからカラムクロマト
に使った時に分離と再現の良い結果が得られます。−CLは更に改良された
製品です。
これを単に球状アガロースと言った時には、結果が保証できなくなります。

ということかな。

ちなみにAgaroseもAgarから高度に生成されたもので、今は主に電気泳動用に
使いますが、今でもバッチカラムではAgaroseを担体にしたものを使いますね。

でも羊羹を作るのはAgarじゃないかと思うのですが。

(無題) 削除/引用
No.568-9 - 2012/05/27 (日) 18:57:19 - Dakogilent
>[Re:8] 直輝さんは書きました :
> Sepharoseはより精製されているので、その不純物がほぼ無いという話だと思います。

 再度コメントありがとうございます。
高純度(電気泳動に使うような)アガロースの球状のものをpharマシアがセpharオースと呼んでいる。と言って良いのかどうか?それとも純度(電荷)、形状(球状、架橋の程度)以外でも何か工夫しているかどうかが、私の質問の本質のようです。

(無題) 削除/引用
No.568-8 - 2012/05/26 (土) 23:00:19 - 直輝
電気的に中性でないと電気泳動なんて出来ませんから、「charged polysaccharides」というのは、Agaroseに含まれる少量の不純物の話だと理解しています。
Sepharoseはより精製されているので、その不純物がほぼ無いという話だと思います。

その不純物が硫黄関連なのか、電荷をもった多糖類のことなのか、情報は持っていません。

(無題) 削除/引用
No.568-7 - 2012/05/26 (土) 21:34:50 - Dakogilent
直輝さまありがとうございます。おもしろいHPで、感謝しています。
> 1. Pure agarose is powdered form while sepharose is more beaded in structure.
> 2. Agarose is a more generic term referring to a type of polysaccharide polymer while sepharose is a trademarked term by GE Healthcare.
> 3. Agarose has more charged polysaccharides compared to sepharose.

私の考えは「2」だけでした。(「1」の形の話は球状アガロースと電気泳動用アガロースは構造を区別して考えていたので、理解はしていました。)
「3」の話に興味があります。ここでいうアガロースの電荷とは精製純度の話なのでしょうか?硫黄分の割合のことを言っているとしたら、電気泳動用に販売されているアガロースは試験済みなので、チャージを持つと言うイメージが無いのですが・・・水羊羹につかう寒天ならチャージを持っていても良さそうですが。


qq様、再度ありがとうございます。
> Sepharoseは、アガロースを球形に形成した製品であって、化合物としてのアガロースと同一ではありません。
> 架橋アガロースは、アガロースを(おそらく)エピクロロヒドリンで架橋してあるので、アガロースそのものと化学構造的に異なっています。

コメントのように架橋あり/なしで構造的に異なることは理解しておりました。どちらかと言えば、私の用語の使い方はgeneric termとして使っているなーと感じております。
球状アガロース(ビーズ状アガロース)はセファロースと同一でしょうか?という質問に読み替えていただけると幸いです。
電荷と言う話が出てきたので、精製アガロースを球状にしたらセファロースになるのか?それとも特別な構造的な修飾(架橋は除く)が行われているのか?が質問の本質かもしれません。

(無題) 削除/引用
No.568-6 - 2012/05/26 (土) 20:53:17 - qq
>セファロースはただの商標であって、結局中身はアガロースですよね。 
Sepharoseは、アガロースを球形に形成した製品であって、化合物としてのアガロースと同一ではありません。
架橋アガロースは、アガロースを(おそらく)エピクロロヒドリンで架橋してあるので、アガロースそのものと化学構造的に異なっています。

(無題) 削除/引用
No.568-5 - 2012/05/26 (土) 20:52:48 - 直輝
似たようなものですが
ttp://www.differencebetween.net/science/health/difference-between-agarose-and-sepharose/

1. Pure agarose is powdered form while sepharose is more beaded in structure.
2. Agarose is a more generic term referring to a type of polysaccharide polymer while sepharose is a trademarked term by GE Healthcare.
3. Agarose has more charged polysaccharides compared to sepharose.
若干ちがいます。

架橋ですね 削除/引用
No.568-3 - 2012/05/26 (土) 18:36:09 - Dakogilent
書き込みありがとうございます。

架橋アガロースとか高度架橋アガロースなどもいろんなメーカーから販売されているので、セファロースはただの商標であって、結局中身はアガロースですよね。 同一だというコメントを頂けて心強いです。

 あとファルマシアは、球状アガロースビーズ(セファロース)を販売しているのに、核酸電気泳動につかうアガロース粉末の販社としては名前を聞きません。
加工する技術はあるけど、テングサから精製する技術(今でもアガロースの製法は天然からの精製なのかは知り得ませんが)は無いのでしょうか?ただの邪推ですが・・・。

(無題) 削除/引用
No.568-2 - 2012/05/26 (土) 15:53:31 - qq
商品名なのだから、同一ではないんじゃないの?
今、Sepharoseとして売り出されているものの多くは、Sepharose CL(架橋アガロース)だと思いますよ。
ProteinA-Sepharoseと呼んでいる多くはSepharose-CL4Bでしょうから、ボイルしても溶解しませんが、単にsepharose-4Bをボイルすると溶解して、冷えるとゲル化してしまいます。

Sepharoseとアガロース 削除/引用
No.568-1 - 2012/05/26 (土) 14:30:48 - Dakogilent
 Sepharoseとアガロースは同一ですか?別物ですか?

Sepharoseはかのメーカーが呼んでいるアガロース担体の商標なので、
同一のものだと考えていました。
それともアガロースに特別な処理を施しているものなのでしょうか?

 ご存知の方、教えていただけないでしょうか。よろしくお願いします。

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