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(無題) 削除/引用 No.5697-2 - 2017/01/23 (月) 19:42:58 - おお トランスジーンにもWTにもある遺伝子の配列でプライマーをつかうと、TGでないマウスを基準にコピー数を見積もれるのでやりやすくないですか？ TGスペシフィックならTG１コピーのスタンダードを作らないといけないし、比較がゲノムに１コピーインテグレートされているものが理想的だけどそうでなければ理想から少しずつ遠のいてゆくし。

qPCRを用いたトランスジーンのコピー数解析 削除/引用 No.5697-1 - 2017/01/22 (日) 12:28:49 - RI お世話になっております。 Tgマウスにトランスジーンが何コピーあるかをqPCRを用いて確認しようと考えております。 それに伴い、まずはコントロールとして内在性の遺伝子しか増幅しないような配列でプライマーを設計し、またトランスジーンが増幅する配列のプライマーを設計して、互いの増幅量からコピー数を判定するかと思います。 今回のトランスジーンは、WTでも存在する遺伝子と別の遺伝子を融合させたものになります。 コントロールに用いるプライマーは決まったのですが、上からの指示でトランスジーン用のプライマーが、トランスジーンにもWTにもある遺伝子の配列でプライマーを設計しろと言われました。確かにこれでも、トランスジーンのみのコピー数は測定できるかと思いますが、わざわざ内在でも存在する部分にプライマーを設計する理由は何が考えられるのでしょうか？ トランスジーン配列において、内在の遺伝子が増えない箇所でプライマーを設計しても良いかと思うのですが。

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