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House keeping protein in CHO? トピック削除
No.5777-TOPIC - 2017/02/22 (水) 02:54:33 - CHO
Hi, there,

I am wondering if you guys know about commonly used loading control of CHO cell lysate in western blotting experiments.

Thanks in advance,

CHO
 
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(無題) 削除/引用
No.5777-10 - 2017/02/23 (木) 19:15:31 - 乙
ハウスキーピング蛋白質(定義があいまいで漠然としたものですが)と言われるものは種間で相同性が(しばしば非常に)高いものも多いとおもうので、添付シートに書いてなくても使える可能性は結構あるとおもいます。ていうかハムスターとかだといちいち検討してない事が多いとおもうので、書いていない=使えないではないではないとおもうし。また、これは、と思うものについてprotein BLAST serach使って調べるとかすることもできます。認識部位がわかれば、そこだけみてもいいです。
コントロールとしてのハウスキーピング蛋白質の妥当性については実験系や方法により大きく左右されますし、いかなる蛋白質でも量が変化しないという保証はありません。この蛋白質がいいとかわるいとかは実験ごとにその都度自分で考えて決める必要があります。適切でないものを選ぶと、結果の解釈を誤ることになるので注意してください。 (低酸素負荷とか、エネルギー代謝動態の変化、アポトーシス等の実験はとくに)

(無題) 削除/引用
No.5777-9 - 2017/02/22 (水) 23:23:36 - 何故?
>[Re:7] 肉さんは書きました :
> ローディングコントロールに使いたいタンパクの抗体をメーカで検索して、ハムとの交差性があるかどうか、ってだけの話ですよね・・・

私もそう思う。まさに、「ってだけ」の話。

まあ、経験談をすると、データシートにハムスターと反応するとは書いていないGAPDH抗体でも、GAPDHと予想されるサイズのバンドが出たことはあります(前のラボでの話で、多分abcamかCell Signaling)。一度試すだけ試してみれば良いんじゃないでしょうかね。別の目的で作ったメンブレンをちょっとストリッピングしてやるだけだからたいした手間じゃないでしょう。

(無題) 削除/引用
No.5777-8 - 2017/02/22 (水) 16:56:09 - おお
>細胞はハムスターですよね。そのアクチンなりGapdhを、人やマウス細胞でルーチンに使う抗体が反応するのか

Then, you should indicate your antibodies you are using for human and mouse cells.

Or can't you just search?

novusbio.com/antibody-news/antibodies/the-importance-of-beta-actin-and-gapdh-loading-controls

nopr.niscair.res.in/bitstream/123456789/6528/1/IJEB%2047(11)%20862-870.pdf

pdfs.semanticscholar.org/fdb1/66e6ea8f13c097447de796c5c59c5f914f75.pdf

academic.oup.com/cardiovascres/article/93/1/130/409921/Caveolin-1-opens-endothelial-cell-junctions-by

abcam.com/alpha-tubulin-antibody-dm1a-loading-control-ab7291.html
Reacts with: Mouse, Rat, Chicken, Guinea pig, Hamster, Cow, Dog, Human, Pig, Xenopus laevis, Gerbil, African green monkey

(無題) 削除/引用
No.5777-7 - 2017/02/22 (水) 16:15:29 - 肉
ローディングコントロールに使いたいタンパクの抗体をメーカで検索して、ハムとの交差性があるかどうか、ってだけの話ですよね・・・

なぜに 削除/引用
No.5777-6 - 2017/02/22 (水) 16:01:12 - 774R
>If your experiment affects actin expression,

を読んで、

>アクチンの発現を変えるようなイベントってあるんですね。

となる???

"If"が目に入らなかったのかな???

(無題) 削除/引用
No.5777-5 - 2017/02/22 (水) 15:44:28 - CHO
おおさんありがとうございます。

アクチンの発現を変えるようなイベントってあるんですね。
確かにそういうイベントの時には不向きですね。
私がとくに気になったのはこの細胞はハムスターですよね。そのアクチンなりGapdhを、人やマウス細胞でルーチンに使う抗体が反応するのかが気になって質問しました。

(無題) 削除/引用
No.5777-4 - 2017/02/22 (水) 11:59:43 - おお
If your experiment affects actin expression, you can not use actin. What I meant was "it depends on YOUR EXPERIMENT", which I do not know.

(無題) 削除/引用
No.5777-3 - 2017/02/22 (水) 11:43:31 - CHO
Depends on what?

(無題) 削除/引用
No.5777-2 - 2017/02/22 (水) 08:51:35 - おお
It depends.

House keeping protein in CHO? 削除/引用
No.5777-1 - 2017/02/22 (水) 02:54:33 - CHO
Hi, there,

I am wondering if you guys know about commonly used loading control of CHO cell lysate in western blotting experiments.

Thanks in advance,

CHO

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