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タンパク質中のジスルフィド結合 トピック削除
No.5869-TOPIC - 2017/03/30 (木) 21:32:47 - ma
表題にありますように今ある分泌タンパク質が分子内でジスルフィド結合するかを推測できないかを調べています。
基本的なこともまだ勉強中ですが、あるシステインと別のシステインがジスルフィド結合するのはどのようにして決まるのでしょうか?
なにかコンセンサス配列のようなものがあるのでしょうか?
抗体のような例もありますので、タンパク質の構造が重要なのはなんとなくわかっているのですが、どなたか教えていただけないでしょうか?
よろしくおねがいします。
 
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(無題) 削除/引用
No.5869-5 - 2017/03/31 (金) 23:28:36 - ma
>[Re:4] 質問乙さんは書きました :
> S-S bondsはプロテインジスルフィドイソメラーゼのような酵素的分子シャペロンで触媒されると思うので、そういうのとフォールディング過程の蛋白質との相互作用とかも絡んでくるので、けっこう奥深いかもしれない。

>[Re:3] おおさんは書きました :
> https:
> 英半角を頭につけてください

おおさん、

URL、ありがとうございます。
見てみます。

質問乙さん、

コメントありがとうございます。
プロテインジスルフィドイソメラーゼ自体にタンパク質をフォールディングする能力(S-S結合の触媒によるフォールディング以外の)があるのでしょうか?他のシャペロンと結合しているような気もします。
いずれにしてもおおさんが引用してくれたサイトでの予測はどのくらい正確なのかが興味あるところですが、最終的にはシステインをつぶすような実験をしないとわからないのでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.5869-4 - 2017/03/31 (金) 18:43:53 - 質問乙
S-S bondsはプロテインジスルフィドイソメラーゼのような酵素的分子シャペロンで触媒されると思うので、そういうのとフォールディング過程の蛋白質との相互作用とかも絡んでくるので、けっこう奥深いかもしれない。

(無題) 削除/引用
No.5869-3 - 2017/03/31 (金) 08:26:50 - おお
https:
英半角を頭につけてください

(無題) 削除/引用
No.5869-2 - 2017/03/31 (金) 08:23:39 - おお
omictools.com/protein-disulfide-bonding-prediction-category

www.expasy.org/resources/search/keywords:secondary%20structure%20prediction

上記URLのなかで
www.predictprotein.org/#
scratch.proteomics.ics.uci.edu/index.html

などPredictionしてくれるプログラムはあるようです。

タンパク質中のジスルフィド結合 削除/引用
No.5869-1 - 2017/03/30 (木) 21:32:47 - ma
表題にありますように今ある分泌タンパク質が分子内でジスルフィド結合するかを推測できないかを調べています。
基本的なこともまだ勉強中ですが、あるシステインと別のシステインがジスルフィド結合するのはどのようにして決まるのでしょうか?
なにかコンセンサス配列のようなものがあるのでしょうか?
抗体のような例もありますので、タンパク質の構造が重要なのはなんとなくわかっているのですが、どなたか教えていただけないでしょうか?
よろしくおねがいします。

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