Bio Technical フォーラム

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DNAシークエンス(sequence)解析用ソフト トピック削除
No.589-TOPIC - 2012/05/30 (水) 14:20:10 - 匿名
はじめて利用します。

ある遺伝子のPCR産物を、シーケンスして、Ab1.ファイルを得ました。

ある塩基がホモかへテロかを判断しようとした場合、そこの波形が、二種類の塩基の波で構成されていて、且つ、その高さが同じである、ということで間違っていませんか。

また、フリーのソフトで、シーケンスの結果と、標準の塩基配列とを比較したり、ホモかへテロかを判断するようなものはありませんでしょうか。

ご回答をお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.589-5 - 2012/06/08 (金) 20:20:00 - 匿名
みなさま、ありがとうございました。たすかりました。


http://www.appliedbiosystems.jp/website/jp/product/modelpage.jsp?BUCD=130&PLCD=128&MODELCD=66272&MODELPGCD=115723

SeqScape® ソフトウェア ver2.5デモソフトウェア (インストールから45日間有効)

上記を使うことにしました。デモソフトでも、どこにヘテロがあるか、一目でわかる表示があり、つかいやすいです。

(無題) 削除/引用
No.589-4 - 2012/06/02 (土) 08:32:10 - AP
http://www.molgen.ua.ac.be/bioinfo/novosnp/
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1532046409001506

(無題) 削除/引用
No.589-2 - 2012/06/01 (金) 22:48:55 - toku
このソフトとかいろいろ出来そうです。
www.mbio.ncsu.edu/BioEdit/bioedit.html
www.mbio.ncsu.edu/BioEdit/screenshots.html

DNAシークエンス(sequence)解析用ソフト 削除/引用
No.589-1 - 2012/05/30 (水) 14:20:10 - 匿名
はじめて利用します。

ある遺伝子のPCR産物を、シーケンスして、Ab1.ファイルを得ました。

ある塩基がホモかへテロかを判断しようとした場合、そこの波形が、二種類の塩基の波で構成されていて、且つ、その高さが同じである、ということで間違っていませんか。

また、フリーのソフトで、シーケンスの結果と、標準の塩基配列とを比較したり、ホモかへテロかを判断するようなものはありませんでしょうか。

ご回答をお願いします。

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