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野生株と欠損株の比較検討について トピック削除
No.5915-TOPIC - 2017/04/17 (月) 23:19:16 - かりんとう
先輩から欠損株を引き継いで野生株と比較検討することとなったのですが、欠損株と野生株で培地が変わります。
そのまま比較検討を行ってよいのでしょうか?
遺伝子系は素人なのですみませんが教えていただけないでしょうか?
 
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No.5915-12 - 2017/04/20 (木) 13:45:13 - 中年
指導教員に相談できない理由があるのですか?

(無題) 削除/引用
No.5915-11 - 2017/04/20 (木) 09:52:12 - おお
そもそもなぜカナマイシンが入っていて、なぜ必要なのかを考えるべきかと思います。
カナマイシンが入ってなくて形質維持可能(少なくとも実験している間)かどうかを考えるといいでしょう。
なんとなく想像つくが想像でこうすると良いとは言えないので詳しくは書きませんが、わからなかったら、カナマイシン+と−両方で野生株と比較してみて、問題があるか見極めていくということも可能かと思います。

(無題) 削除/引用
No.5915-10 - 2017/04/20 (木) 07:15:08 - Why
>光応答性遺伝子を欠損させているので強光条件下で培養して生育に差異があるのか(活性酸素種による影響)を調べようとしてます。
>※遺伝子の機能解明が目的です
>欠損株の培地にはカナマイシンを添加しています。

なぜ最初からその情報を出さないかな?

(無題) 削除/引用
No.5915-9 - 2017/04/20 (木) 06:51:22 - 中年
欠損株の選択にはカナマイシン耐性を使っただろうけど、いちど株が出来てしまえばカナマイシンは必要ないのでは?

(無題) 削除/引用
No.5915-8 - 2017/04/20 (木) 00:21:54 - かりんとう
みなさま返信ありがとうございます。

光応答性遺伝子を欠損させているので強光条件下で培養して
生育に差異があるのか(活性酸素種による影響)
を調べようとしてます。
※遺伝子の機能解明が目的です

欠損株の培地にはカナマイシンを添加しています。

(無題) 削除/引用
No.5915-7 - 2017/04/18 (火) 12:49:57 - Nanashi_et_al
なにを比較するのか書かれてないけど、そのままはダメっしょ?
「培地が違くことを考慮して」比較しないとな

(無題) 削除/引用
No.5915-6 - 2017/04/18 (火) 10:49:34 - mon
組成が明らかなでないので推測になりますが、欠損株用の培地は野生株が増殖(生存)しづらく欠損株のみ優先的に増えるようになっているか、その逆で欠損株のみある栄養素(アミノ酸?)が必要でそれを添加してあるのではないでしょうか。
これは、欠損株が二次的変異等で野生株様の表現型に戻らないようにするため、あるいは区別が容易につくようにするためです。
もし、そうなら野生株用の培地あるいは欠損株用の培地のどちらかで、両方の株は増殖できるでしょう。そのような培地で数世代培養し馴化させて、比較実験を行えば良いでしょう。ただし、前もって増殖曲線等を描いてみて両者で差がないことを確認した方が良いです(差があっても比較実験はできますが)。

(無題) 削除/引用
No.5915-5 - 2017/04/18 (火) 10:20:50 - 小言幸兵衛
何を比較するのですか?

ゲノム配列を比較するのであれば問題ないでしょうね。

(無題) 削除/引用
No.5915-4 - 2017/04/18 (火) 08:16:33 - おお
You can compare them growing in different media. I wouldn't say "you can not". What is really important is whether you can draw a conclusion.

It may be unavoidable to use different media. In this case, you should think harder.

(無題) 削除/引用
No.5915-3 - 2017/04/18 (火) 07:35:46 - それは
そのまま比較するのはダメです

(無題) 削除/引用
No.5915-2 - 2017/04/17 (月) 23:39:09 - おお
It depends.

野生株と欠損株の比較検討について 削除/引用
No.5915-1 - 2017/04/17 (月) 23:19:16 - かりんとう
先輩から欠損株を引き継いで野生株と比較検討することとなったのですが、欠損株と野生株で培地が変わります。
そのまま比較検討を行ってよいのでしょうか?
遺伝子系は素人なのですみませんが教えていただけないでしょうか?

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