Bio Technical フォーラム

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qPCRにおけるUNG (AmpErase)の必要性 トピック削除
No.5984-TOPIC - 2017/05/23 (火) 00:07:42 - meso
いつも勉強させていただいております。
LifeTechnologiesから出ているmaster mixはUNG (AmpErase)が添加されているものといないものがあり、どちらの商品を購入するか考えています。

UNGはdUを含む二本鎖DNAを分解するので、PCR産物のキャリーオーバーによるコンタミが防げるとの触れ込みですが、この意味がよくわからなくて戸惑っています。

自分の実験は、total RNA-> cDNA ->qPCRというごく普通の流れですが、このプロセスにPCR産物があるようには思えませんのですが。。。
また、微量RNAの場合はPCRによるターゲットPreAmpを行いますが、この反応にdUTPが入っているとも思えません。

アドバイスいただければ幸いです。
 
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(無題) 削除/引用
No.5984-3 - 2017/05/24 (水) 02:01:14 - meso
おおさんありがとうございます。
ということはピペットとか試薬の汚染によるコンタミの対策ということですね。
UNG無しでいい気がしてきました。

(無題) 削除/引用
No.5984-2 - 2017/05/23 (火) 07:54:10 - おお
常日頃dUTPをつかってqPCRなどをしているならば、過去の実験で増幅されたDNAが混じっていたとしてもUNGで消化できるのでコンタミによる影響を受けないということではないでしょうか。

qPCRにおけるUNG (AmpErase)の必要性 削除/引用
No.5984-1 - 2017/05/23 (火) 00:07:42 - meso
いつも勉強させていただいております。
LifeTechnologiesから出ているmaster mixはUNG (AmpErase)が添加されているものといないものがあり、どちらの商品を購入するか考えています。

UNGはdUを含む二本鎖DNAを分解するので、PCR産物のキャリーオーバーによるコンタミが防げるとの触れ込みですが、この意味がよくわからなくて戸惑っています。

自分の実験は、total RNA-> cDNA ->qPCRというごく普通の流れですが、このプロセスにPCR産物があるようには思えませんのですが。。。
また、微量RNAの場合はPCRによるターゲットPreAmpを行いますが、この反応にdUTPが入っているとも思えません。

アドバイスいただければ幸いです。

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