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CRISPR,HDRにおける相同組み換えの図について トピック削除
No.6732-TOPIC - 2018/03/01 (木) 22:09:37 - peppers
CRISPR-Casについて勉強しています。他愛もない質問で申し訳ないのですが、教えてください。
Casによって2本鎖DNAを切断(DSB)したのち、donor plasmidを用いてHDR修復を生じさせる図をみています。
多くの解説図において、donor plasmidの相同性左腕/右腕と、切られたDNAの両端との間に×印が書かれています。この×印をみると、一見塩基配列が反転するような印象を受けるのですが、それは間違っていますよね?
(donorの中で相同性左腕と右腕に挟まれた配列が、そのまま向きを変えず切断された部位にはまり込むという理解で間違いないですか?)
 
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(無題) 削除/引用
No.6732-4 - 2018/03/03 (土) 08:54:33 - AP
ホリデイ中間体のイメージ?

(無題) 削除/引用
No.6732-3 - 2018/03/02 (金) 09:38:21 - AA
あのXは相同組換え時の交叉を示していたのですね。
そういう慣習かと思い深く考えていませんでしたが勉強になりました。

ちなみにターゲティングベクターの相同領域と、ゲノムの対応領域の両端を
互い違いに点線で結ぶのは別段ゲノム編集独特ということは無いと思います。
また、交差させずにつなぐ図もあるように思います。

(無題) 削除/引用
No.6732-2 - 2018/03/02 (金) 07:36:22 - mon
www.biotechniques.com/news/366696

CRISPR,HDRにおける相同組み換えの図について 削除/引用
No.6732-1 - 2018/03/01 (木) 22:09:37 - peppers
CRISPR-Casについて勉強しています。他愛もない質問で申し訳ないのですが、教えてください。
Casによって2本鎖DNAを切断(DSB)したのち、donor plasmidを用いてHDR修復を生じさせる図をみています。
多くの解説図において、donor plasmidの相同性左腕/右腕と、切られたDNAの両端との間に×印が書かれています。この×印をみると、一見塩基配列が反転するような印象を受けるのですが、それは間違っていますよね?
(donorの中で相同性左腕と右腕に挟まれた配列が、そのまま向きを変えず切断された部位にはまり込むという理解で間違いないですか?)

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