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Cre-loxPで除去された配列からのcDNA発現 トピック削除
No.6812-TOPIC - 2018/04/04 (水) 20:18:29 - xyz
Cre-loxPで除去された配列にプロモーター+cDNA+stopが含まれる場合、その切り出された環状DNAからcDNAが発現することがあるようなのですが、環状DNAが分解されるまでの時間はどの程度かかるものなのでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.6812-4 - 2018/04/05 (木) 12:06:28 - xyz
PP様
私が見たのはこちらの文献です。
http://gakui.dl.itc.u-tokyo.ac.jp/data/h18/122518/122518a.pdf
2ページ目に分かりやすい図と、その発現が言及されております。

おお様
ですよね。。。
cDNA+stopは書き間違えです。正しくはcDNA+polyAでした。

(無題) 削除/引用
No.6812-3 - 2018/04/05 (木) 10:47:49 - おお
ポリAシグナルがついてないと発言しないけど。

(無題) 削除/引用
No.6812-2 - 2018/04/05 (木) 04:34:46 - PP
> Cre-loxPで除去された配列にプロモーター+cDNA+stopが含まれる場合

というのがイメージできないのですが、どの様な場合を想定しているのでしょう?

Conditional knockoutの場合、プロモーターと全てのエクソンをloxPで挟むデザインは見たことがないですね。cDNAとあるので、プラスミドやウイルスで導入した後、Creで切り出すような場合でしょうか?

自分ではやった事がないですが、切り出される配列内部にプライマーを設定して追跡すれば、ある程度の事は分かりそうな気もしますが。

Cre-loxPで除去された配列からのcDNA発現 削除/引用
No.6812-1 - 2018/04/04 (水) 20:18:29 - xyz
Cre-loxPで除去された配列にプロモーター+cDNA+stopが含まれる場合、その切り出された環状DNAからcDNAが発現することがあるようなのですが、環状DNAが分解されるまでの時間はどの程度かかるものなのでしょうか?

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