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ソニケーション時に泡立たせなくする工夫を教えてください。 トピック削除
No.6880-TOPIC - 2018/04/30 (月) 14:29:51 - 泡姫
大腸菌をソニケーションで破壊し、タンパク質精製を行いたいのですが、500 ml LBで培養した菌体を30 mlのTris, NaCl, 1% Tx100, lysozyme, DNAse, PMSFの組成内で破壊しています。

ソニケーションを加えて漸く破壊してくれます。本当は熱が出たり泡が出たりして使いたくないのですが、止むを得ずです。

その際、超音波の出るノズルというのか金属製のものを50 ml tubeに差し込み、氷上で1 minほどソニケーションしますが、泡立つことが多いです。そうなると途端にソニケーション時に不快な音が聞こえなくなります。つまりソニケーションがうまくいっていないのかもですね。

質問は、私の場合lysozymeだけではだめなのでソニケーションが必要です。どうしたらソニケーションを泡立たせずうまく行えるでしょうか?かなり漠然とした質問で恥ずかしいのですが、よろしくお願いします。
 
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No.6880-5 - 2018/04/30 (月) 17:02:47 - 1q2w3え4r5t6y7う8い9
超音波のチップを溶液に入れるときのその深さでだいぶ変わるように気がしている。深さを変えて一番泡立たないところでやったら多少改善されるとおもう。超音波処理は発熱の問題もあるけど、他に水がこわれてOHラジカル(活性酸素のなかでも反応性が高い)の発生を伴う場合がある(キャビテーションていうやつ)ので、活性のある蛋白質の精製を目的としているならば十分注意したほうがいい。
フレンチプレス(圧力で細胞破砕する機械で酵母とか菌体とか植物組織の破砕に使われる)とかビーズで激しく震盪してこわす機械のほうが良いような気がする。

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No.6880-4 - 2018/04/30 (月) 15:23:29 - SYBR master
先におおさんが書いていますが、1minぶっ続けでは無く、1回5秒とか10秒とかで、回数で1分にするのが常道だと思います。この方が熱の発生も最小限にできます。

また、Sonicではなく、BugbusterとかB-PERとかの市販の菌体破砕液では駄目なのですか?使った感じでは、Bugbusterとかかなり楽ちんですが。

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No.6880-3 - 2018/04/30 (月) 15:18:19 - おお
例えば10秒ONにして10秒止めて合計で2分やるとかよくやると思うんですが、1分ぶっ続けでやってますか?

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No.6880-2 - 2018/04/30 (月) 15:15:25 - AA
泡が立つのは界面活性剤のせいでは?

ソニケーション時に泡立たせなくする工夫を教えてください。 削除/引用
No.6880-1 - 2018/04/30 (月) 14:29:51 - 泡姫
大腸菌をソニケーションで破壊し、タンパク質精製を行いたいのですが、500 ml LBで培養した菌体を30 mlのTris, NaCl, 1% Tx100, lysozyme, DNAse, PMSFの組成内で破壊しています。

ソニケーションを加えて漸く破壊してくれます。本当は熱が出たり泡が出たりして使いたくないのですが、止むを得ずです。

その際、超音波の出るノズルというのか金属製のものを50 ml tubeに差し込み、氷上で1 minほどソニケーションしますが、泡立つことが多いです。そうなると途端にソニケーション時に不快な音が聞こえなくなります。つまりソニケーションがうまくいっていないのかもですね。

質問は、私の場合lysozymeだけではだめなのでソニケーションが必要です。どうしたらソニケーションを泡立たせずうまく行えるでしょうか?かなり漠然とした質問で恥ずかしいのですが、よろしくお願いします。

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