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(無題) 削除/引用 No.6992-3 - 2018/06/11 (月) 09:25:23 - xyz 超幾何分布検定 The GO::TermFinder determines whether an observed level annotations for a group of genes is significant within the context of annotation for all genes within a reference set of genes. see https://puma.princeton.edu/help/GO-TermFinder/GO_TermFinder_help.shtml#algorithm http://mathworld.wolfram.com/HypergeometricDistribution.html 原著くらい読みましょう。 GO::TermFinder—open source software for accessing Gene Ontology information and finding significantly enriched Gene Ontology terms associated with a list of genes ttps://academic.oup.com/bioinformatics/article/20/18/3710/202612

SGDのGO解析の統計検定は何検定？ 削除/引用 No.6992-1 - 2018/06/10 (日) 14:12:18 - 火星人 当方、出芽酵母のある遺伝子郡に対してSGD(Saccharomyces Genome Database)でGO解析を行いました。 そのGO解析(findTermsというモードです)でp-valueが結果として出てくるのですが、このp-valueを算出している統計検定が何であるか明示されていなく、困惑しております。 どなたか知っている方が入ればご教授願いたいです。 また、他に統計検定法が明示してありわかりやすいサイト等もあれば教えていただきたいです。

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