Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

超遠心後のペレット トピック削除
No.7158-TOPIC - 2018/08/21 (火) 09:50:56 - つん
組織破砕サンプルを超遠心(10万Gで1時間)にかけ、不要な物を沈降させて必要な目的物を上清から回収します。
残ったペレットがもったいないので、別のアッセイに使用できないかと考えています。
10万Gで遠心した後のペレットはどんな状態なのでしょうか?
例えば、そのペレットから核タンパクを抽出したりできますか?

上清をとるのが一番の目的なので、超遠心をかけ終わるまでのプロトコルは変更できません。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



6件 ( 1 〜 6 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.7158-6 - 2018/08/22 (水) 16:17:24 - AP
>ダウンス型ホモジナイザーで組織をつぶす予定ですが、この方法だと核は壊れるでしょうか?
バッファーはPBSにプロテアーゼインヒビターを添加したものです。

手加減によります。ちゃんとやるならいい条件を見つけておく必要があるでしょう。ポッター型なんかだとクリアランス(ペッスルとガラス器の隙間)が緩めの組み合わせにしたりします。

あとMg++があると核膜が固くなっって壊れにくくなるので、核狙いのときは5 mMほどMgCl2を入れときます。

ありがとうございます 削除/引用
No.7158-5 - 2018/08/22 (水) 15:46:49 - つん
APさま、おおさま
ご返信ありがとうございます。

デタージェント無しでやるので、何かしらの膜フラクションはとれてきそうですね。

>破砕のしかたによるでしょう。
核が壊れないようにしたなら、核は回収できます。

ダウンス型ホモジナイザーで組織をつぶす予定ですが、この方法だと核は壊れるでしょうか?
バッファーはPBSにプロテアーゼインヒビターを添加したものです。

>もっともインタクトな核を回収するなら、数百Gで十分。余計なものが落ちないだけきれいに取れる。そうやって核(やミトコンドリア)を除いてから本チャンの超遠心にかけるというのもスマート。

この方法も検討してみたいと思います。

(無題) 削除/引用
No.7158-4 - 2018/08/21 (火) 11:17:11 - おお
デタージェントが入っていないならMicrosomeなどの膜フラクションは回収できているとおもう。ポリソームや場合によってはリボソームなどもこれぐらいなら回収できるんじゃないかと(これは必要ならちゃんと調べてください)。

デタージェントが入っていたらデタージェントに耐性の巨大分子(重合したアクチンとか)が落ちてきそうだけど。プリオンみたいな細胞内外でアグったものとかもこの程度の遠心で回収するんじゃないかな。

(無題) 削除/引用
No.7158-3 - 2018/08/21 (火) 10:26:51 - AP
もっともインタクトな核を回収するなら、数百Gで十分。余計なものが落ちないだけきれいに取れる。そうやって核(やミトコンドリア)を除いてから本チャンの超遠心にかけるというのもスマート。

(無題) 削除/引用
No.7158-2 - 2018/08/21 (火) 10:03:35 - AP
破砕のしかたによるでしょう。
核が壊れないようにしたなら、核は回収できます。
そうでなくてもオルガネラ膜、細胞膜(に由来する小胞)は回収できるでしょう。膜タンパク質を濃縮するのに使う手です。

超遠心後のペレット 削除/引用
No.7158-1 - 2018/08/21 (火) 09:50:56 - つん
組織破砕サンプルを超遠心(10万Gで1時間)にかけ、不要な物を沈降させて必要な目的物を上清から回収します。
残ったペレットがもったいないので、別のアッセイに使用できないかと考えています。
10万Gで遠心した後のペレットはどんな状態なのでしょうか?
例えば、そのペレットから核タンパクを抽出したりできますか?

上清をとるのが一番の目的なので、超遠心をかけ終わるまでのプロトコルは変更できません。

6件 ( 1 〜 6 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。