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Goland-吉木法について トピック削除
No.750-TOPIC - 2012/07/12 (木) 15:00:57 - 染色マシン
類骨染色のGoland-吉木法について質問です。
(周りに精通していらっしゃる方がいませんので、広く
ご意見を伺いたく、投稿させていただきます)


骨肉腫検体で、パラフィン切片を作る予定です。
まずはGoland-吉木法でオステオイドを確認し、そのパラフィン
切片からDNAを抽出して、遺伝子解析をする予定です。

そこで質問ですが、組織を10%中性緩衝ホルマリンで固定後、
塩化シアヌル液(組成:塩化シアヌル、メタノール、4-メチル
モルホリン)で再固定してしまいますが、組織内のDNAに対し、
この再固定が後のDNA解析に影響することはないでしょうか。

これまで、パラフィン切片を用いたPCR法、in situは経験あり
ますが、塩化シアヌル液を使った方法は初めてですので、
どんな影響があるのか・・・検体が少ないので、予備検討もまま
ならず、どなたかご経験があれば教えてくださいますでしょうか。
 
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(無題) 削除/引用
No.750-4 - 2012/07/12 (木) 23:59:16 - sedou
塩化シアヌルなんて初めて聞いたので、興味本位で調べてみました。塩化シアヌルというのは活性塩素(こういう言葉も初めて聞きました)を持つ、かなり反応性の高い薬品のようですね。ホルマリンと似て、アミノ基(2級に結合するというのは確認しましたが、それ以外は見つからず)や糖鎖の水酸基などに結合するようです。固定はこのあたりの反応性の高さを利用した訳でしょう。とすると、普通に考えるとDNAはかなりダメージを受けると考えた方が自然なような気はします。

骨肉腫だからと言ってこんなに強く固定する理由はなんでしょう?単純に強く固定したいだけならPFA中に長くつけば良いだけのように、素人には思えるのですが。

(無題) 削除/引用
No.750-3 - 2012/07/12 (木) 23:31:24 - Harmonia
>この再固定が後のDNA解析に影響することはないでしょうか。

DNA解析手法のどれかには、影響するでしょうね。
というぐらいしか、答えにくい。

具体的に、どういう解析を予定しているか、列挙して。
そしたら、それをやったことある人は、大丈夫だったとかダメだったとか言いやすいから。

(無題) 削除/引用
No.750-2 - 2012/07/12 (木) 21:41:21 - ami
http://www.kenkyuu2.net/cgi-biotech2012/biotechforum.cgi?mode=view;Code=748

Goland-吉木法について 削除/引用
No.750-1 - 2012/07/12 (木) 15:00:57 - 染色マシン
類骨染色のGoland-吉木法について質問です。
(周りに精通していらっしゃる方がいませんので、広く
ご意見を伺いたく、投稿させていただきます)


骨肉腫検体で、パラフィン切片を作る予定です。
まずはGoland-吉木法でオステオイドを確認し、そのパラフィン
切片からDNAを抽出して、遺伝子解析をする予定です。

そこで質問ですが、組織を10%中性緩衝ホルマリンで固定後、
塩化シアヌル液(組成:塩化シアヌル、メタノール、4-メチル
モルホリン)で再固定してしまいますが、組織内のDNAに対し、
この再固定が後のDNA解析に影響することはないでしょうか。

これまで、パラフィン切片を用いたPCR法、in situは経験あり
ますが、塩化シアヌル液を使った方法は初めてですので、
どんな影響があるのか・・・検体が少ないので、予備検討もまま
ならず、どなたかご経験があれば教えてくださいますでしょうか。

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