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比重が上がるのは、何でありますか? トピック削除
No.7610-TOPIC - 2019/01/25 (金) 17:17:17 - レベル29のライチュウ
こんにちは。

アガロースゲルローディングバッファーにはグリセロールやスクロース、Ficollが入ってDNAとRNAの比重をあがります。しかし何のため比重が上がりますか?三つ全部べたべたなものであるが、密度と関係ありますか?

比重と密度で何が違いますか?
 
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お返答ありがとうございます。 削除/引用
No.7610-4 - 2019/01/26 (土) 15:04:40 - レベル29のライチュウ
お返答ありがとうございます。

バッファーにグリセロールやスクロース、そしてFicollを入ればDNA溶液の比重がTAE、TBEバッファーより大きくなって、沈むのですね。
英語には単純にDensityだと書いて紛れてしまいました。

(無題) 削除/引用
No.7610-3 - 2019/01/25 (金) 20:12:51 - AP
バッファーより重くないとサンプルがウェルの中に沈まないからです。

密度は単位体積あたりの質量で、例えば g/mLで表される数値。
比重は単位となる物質の密度を1としたときの物質の密度の比。
水を1としたときエタノールの比重は0.8のように。比率なので単位はつかない。

グリセロールやフィコールは粘性が高いけれど、ショ糖液はそんなに粘性はない。グリセロールなど粘性の高い試薬でサンプルの比重を高くすると、バンドがゆがみやすい。メニスカスが深くなるためウェルの両端にサンプルが加重して水平ゲルならアレイ型、垂直ゲルならU字型のバンドになりがち。
その点、ショ糖ベースのサンプルバッファーならサンプルがフラットに沈むのできれいなバンドになりやすい。

私はどこかの雑誌で読んで、尿素で重み付けしたサンプルバッファーを自作して使用している。

(無題) 削除/引用
No.7610-2 - 2019/01/25 (金) 18:44:16 - おお
>DNAとRNAの比重をあがります。

DNAとRNAの溶液の比重があがります。

たとえば100mlの水にFicoll10gをとかして、容積が101mlになったら110gで体積101mlなので水より比重がたかい。

グリセロールは液体だけど比重は1.25付近(たぶん)で水よりおもいし、Ficollと同様なことが起こっているともいえるし、単に水とグリセロールの量を考慮に入れて平均したとしても比重はあがっている。

シュークロースとグリセロールは超遠心などでいろいろな割合でまぜて、いろいろな比重の溶液をつくり、重いほうを下にして何層かかさねることで、密度勾配を作って分子などを分離することがある。

べたべたは関係ないです尿素を溶かしても比重は高いですし、NaClを溶かしてもそうなるでしょう。

比重が上がるのは、何でありますか? 削除/引用
No.7610-1 - 2019/01/25 (金) 17:17:17 - レベル29のライチュウ
こんにちは。

アガロースゲルローディングバッファーにはグリセロールやスクロース、Ficollが入ってDNAとRNAの比重をあがります。しかし何のため比重が上がりますか?三つ全部べたべたなものであるが、密度と関係ありますか?

比重と密度で何が違いますか?

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