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糖鎖修飾されたタンパク質の立体構造解析 トピック削除
No.7632-TOPIC - 2019/01/31 (木) 19:17:12 - とーさ
タンパク質の立体構造を解析したいと考えているのですが、そのタンパク質は数箇所糖鎖修飾されています。

糖鎖の部分は構造が見れなくてよいので、タンパク質部分の全体の構造変化に注目しております。

糖鎖は構造がゆらいでいると思うのですが、一般的に糖鎖のついたタンパク質の結晶構造解析や、クライオ電子顕微鏡解析というのはできないのでしょうか?

それとも、糖鎖がついていても、タンパク質部分のみを構造解析できるのでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.7632-2 - 2019/02/01 (金) 00:13:20 - WInter-8
私自身に経験はありませんが、糖鎖修飾されたタンパク質の構造解析例はあります。

結晶構造解析の場合、結晶化するには均一に糖鎖修飾されている必要があります。均一というのは、同じ箇所に同じ糖鎖が修飾されているという意味です。
タンパク質の構造だけが知りたいのであれば、あえて糖鎖修飾をさせないこともあります。フレキシブルな部分が減るので、結晶化には都合が良いです。

クライオ電子顕微鏡の場合、糖鎖修飾にバリエーションがあっても測定できると思います。ただ、装置に依存する部分や目的タンパク質の分子量・対称性などにも依存するので、専門家に個別に相談するのをお勧めします。

糖鎖修飾されたタンパク質の立体構造解析 削除/引用
No.7632-1 - 2019/01/31 (木) 19:17:12 - とーさ
タンパク質の立体構造を解析したいと考えているのですが、そのタンパク質は数箇所糖鎖修飾されています。

糖鎖の部分は構造が見れなくてよいので、タンパク質部分の全体の構造変化に注目しております。

糖鎖は構造がゆらいでいると思うのですが、一般的に糖鎖のついたタンパク質の結晶構造解析や、クライオ電子顕微鏡解析というのはできないのでしょうか?

それとも、糖鎖がついていても、タンパク質部分のみを構造解析できるのでしょうか?

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