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PFGEでのトラブル 削除/引用 No.7676-4 - 2019/02/12 (火) 11:56:15 - こるぶる おお様 ご返信いただき誠にありがとうございます。 問題の画像をお見せできずもどかしいのですが、いただいたCDCの資料画像のA1レーンくらいスメアが出現しています。ただ、バンドはこちらの画像よりも薄いため識別が難しい状態です。 市販のマーカーも流しておりまして、サンプルと比べてみるとサンプルよりも濃いスメアを引いていました。 そもそも、サンプルのDNA量が少なすぎて相対的にバンドの間が光って見えるのかもしれません。 大変貴重なご意見誠にありがとうございます。

(無題) 削除/引用 No.7676-3 - 2019/02/12 (火) 08:25:21 - おお https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/17/2/10-1022-f1 これと比べてどうでしょうか？ あとマーカーがあれば電気泳動自身の問題か、サンプルかサンプル調製が原因かはっきりするかと思います。 イメージの取得（写真のとりかた）でも結構印象が変わったりもするでしょうし、たとえばよく白黒反転させたりして示しているものもあります。結構見た感じが変わったりします。

(無題) 削除/引用 No.7676-2 - 2019/02/12 (火) 08:00:31 - おお 経験はないのだけど、制限酵素処理が完全じゃないか、行き過ぎでスター活性などを見ているとか。

PFGEでのトラブル 削除/引用 No.7676-1 - 2019/02/11 (月) 20:11:39 - こるぶる こんにちは。PFGEがうまくいかず、相談させていただきます。 サルモネラのPFGE解析を行っているのですが、いまいちきれいなバンドが得られません。バンドパターンは確認できるのですが、同じレーン上でバンドとバンドの間にもスメアのようなものがあり、論文などでよく見るようなクリアなバンドとなっていません。 同様の経験をお持ちの方、いらっしゃらないでしょうか。 チオ尿素（20μM）を泳動バッファーやゲルに加えることも試したのですが、かわりませんでした。 試薬なのか、手技なのか、泳動条件なのか、全く原因が分からず困っております。 ちょっとしたことでかまいませんので思いあたる方がいらっしゃいましたらご教示いただけますと幸いです。 どうぞ、よろしくお願いいたします。

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