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安価な核酸の定量機器 トピック削除
No.7719-TOPIC - 2019/02/26 (火) 17:41:43 - 低予算
これまでは普通に置いてあって安易に使用してましたが、吸光度計は結構なお値段のする機器なんだと痛感しております。

と申しますのも、限られた予算で、ほぼゼロの状態から核酸取り扱いの環境を整える必要に直面しております。

表題の通りですが、安価な核酸の定量機器でお勧めの機種がございましたら、「メーカー・型番・定価(ざっくりで可)」を教えて下さい。あるいは「ここに良い中古品が売ってるよ。」といった情報でも構いません。

自分が調べた中では、ThermoFisher(Invitorgen)のQubit(30万円)は確認しました。

もしくは、吸光度測定ではない代替方法でも構いませんが、濃度としては高くない核酸標品(〜1ng/uL)を想定しております。

よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.7719-9 - 2019/02/28 (木) 11:04:48 - 低予算
ぺんぺん さん
AP さん
おお さん
asan さん

返信、ありがとうございます。

どこまで書くか悩みましたため、核酸とだけ記載させて頂きました。
もう少しだけ補足させて頂くと、土壌中からランダムに核酸を抽出して、
その中のある特定種を検出予定です。

さらに、とある測定場所にて実施するため、実験を行う建屋はありますが、
イメージとしては単なる空間で、設備面として、まずは最低限の機器を
実質ゼロから限られた予算で揃えてからのスタートといった状況になります。

APさんが提案して下さったのは魅力的だなと思いました。上記の様なサンプル
なので、紫外線スポットによる画像ソフト解析は多少不安でした(私も学生実験
では体験したくちです)。

・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・・
おおさんが抜けており、大変失礼致しました。

(無題) 削除/引用
No.7719-8 - 2019/02/28 (木) 11:02:30 - 低予算
ぺんぺん さん
AP さん
asan さん

返信、ありがとうございます。

どこまで書くか悩みましたため、核酸とだけ記載させて頂きました。
もう少しだけ補足させて頂くと、土壌中からランダムに核酸を抽出して、
その中のある特定種を検出予定です。

さらに、とある測定場所にて実施するため、実験を行う建屋はありますが、
イメージとしては単なる空間で、設備面として、まずは最低限の機器を
実質ゼロから限られた予算で揃えてからのスタートといった状況になります。

APさんが提案して下さったのは魅力的だなと思いました。上記の様なサンプル
なので、紫外線スポットによる画像ソフト解析は多少不安でした(私も学生実験
では体験したくちです)。

(無題) 削除/引用
No.7719-7 - 2019/02/28 (木) 07:44:50 - AP
>普通のシンプルな分光光度計なら安いものだと10万程度で買えると思いますけど?

UV域までカバーする分光光度計はそれなりに高価です。
リンクにある製品は350 nm〜で核酸には不向きですね。

(無題) 削除/引用
No.7719-6 - 2019/02/28 (木) 06:12:34 - おお
>普通のシンプルな分光光度計なら安いものだと10万程度で買えると思いますけど?

私もこのあたりのものを示そうかと思いました。ただ質問で示された濃度では誤差的に10%以上になるかなと思って。どうなんでしょう、可視領域でベースラインを見ながら計算するなどでもっと改善できるとかあればいいですけど。〜1ng/uLだからODで0.02以上ですか。まあ感覚的には測れなくはないかなって言うのはありますけどね、特にそれ以上だと。

あとアズワンのものはどんな感じかつかめないです。

その濃度あたり以下で精度を出すにはもっと高いスペックになるし。

(無題) 削除/引用
No.7719-5 - 2019/02/27 (水) 10:36:24 - asan

普通のシンプルな分光光度計なら安いものだと10万程度で買えると思いますけど?
https://www.airis1.co.jp/item/detail/4149596709

大学とかなら、共通機器とかで古いのが使用できたりすることはないですかね?
ま、一番いいのはいらなくなったラボからもらうとか引き継ぐのがベストでしょうが。

(無題) 削除/引用
No.7719-4 - 2019/02/27 (水) 02:43:57 - おお
確かに蛍光が測れるプレートリーダーがあればHoechstで測れるし、EtBrでも良さそうだしそうすれば安上がりかもしれない。
https://www.biotek.com/resources/application-notes/dna-quantification-using-hoechst-33258/

(無題) 削除/引用
No.7719-3 - 2019/02/26 (火) 18:28:53 - AP
Qubitは蛍光色素をかませる蛍光定量ですが、
同様の製品にPromegaのQuantusがあって本体はもっと安い。
https://www.promega.jp/products/fluorometers-luminometers-multimode-readers/fluorometers/quantus-fluorometer/?catNum=E6150
Promegaは機器リースにも力を入れているので、使い方によってはそっちのほうが安くつくかも。
いずれにせよ、測定に使用するPicoGreenなどの螢光試薬が結構高いので、ランニングコストは考慮に入れておかないと。
それと、上記のような専用機器がなくても蛍光プレートリーダーがあるなら、それ用の蛍光試薬で定量ができる。

それと、いまの人は何でもかんでもnonoDropなんかで測るんだけど、おおくの実験ではEtBrの比色定量でも十分な精度だと思うけどな。実際それでほとんど用が足りてる。
Molecular Cloningにもサランラップ法とか泳動してlambda Hind3マーカーなんかとEtBr比色で量を見積もるという方法、出てなかったっけ?

(無題) 削除/引用
No.7719-2 - 2019/02/26 (火) 17:50:32 - ぺんぺん
eBayでusedのものを探してみてはいかがかな。

安価な核酸の定量機器 削除/引用
No.7719-1 - 2019/02/26 (火) 17:41:43 - 低予算
これまでは普通に置いてあって安易に使用してましたが、吸光度計は結構なお値段のする機器なんだと痛感しております。

と申しますのも、限られた予算で、ほぼゼロの状態から核酸取り扱いの環境を整える必要に直面しております。

表題の通りですが、安価な核酸の定量機器でお勧めの機種がございましたら、「メーカー・型番・定価(ざっくりで可)」を教えて下さい。あるいは「ここに良い中古品が売ってるよ。」といった情報でも構いません。

自分が調べた中では、ThermoFisher(Invitorgen)のQubit(30万円)は確認しました。

もしくは、吸光度測定ではない代替方法でも構いませんが、濃度としては高くない核酸標品(〜1ng/uL)を想定しております。

よろしくお願いします。

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