Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

コンディショナルノックアウトマウスの表記の見方について トピック削除
No.7900-TOPIC - 2019/05/18 (土) 19:33:29 - バイオ実験初心者
初めて投稿させていただきます。
今月からCre-LoxP系のコンディショナルノックアウトマウスの管理を手伝うことになりました。

たくさん種類があるので、右も左も分からなくて勉強を始めたばかりです。
非常に基本的なことで申し訳ないのですが、コンディショナルノックアウトマウスの表記の意味がいまいち理解できていません。

例えば、Al-Cre/CBP-flox homoやColl-cre/CBP-flox homoと記載があります。

私の理解では、〇-cre/△-flox homoは、△が欠損した遺伝子で、欠損させる場所が〇という理解なのですが、正しいでしょうか?

また、Coll-cre/CBP-flox homoniついて勉強しようとしても検索にひっかかってこないのですが、表記が一般的ではないのでしょうか?Collはcollagenのことだと思うのですが...


こんな質問で申し訳ございませんが、ご教授いただけましたら幸いです。
宜しくお願い致します。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



2件 ( 1 〜 2 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.7900-2 - 2019/05/20 (月) 01:41:21 - AP
欠損させる場所というよりCreを発現させるのに使っているプロモーターの由来遺伝子です。その遺伝子の発現パターンでCreが発現しloxP配列間の組換えが起こります。どこでいつ発現するかは基本的に由来遺伝子の発現パターンを調べたらよろしい。ただし発現パターンを完全にミミックしているとは限らないので、原著などを当たってその系統の記載情報を確認するのが一番。
floxはflanked loxP (loxP flanked)で当該遺伝子をloxP配列で挟んでいるということです。Creで組換えが起こると挟んだ部分が離脱します。

お示しの遺伝子型の表記はフォーマルなものでは無いようです。研究室内ではいちいち正式な表記をせず略記されていることも多いです。そのラベルから文献を探したり素性を知るのは無理でしょう。管理者などから原著論文などの情報をもらわないといけない。

コンディショナルノックアウトマウスの表記の見方について 削除/引用
No.7900-1 - 2019/05/18 (土) 19:33:29 - バイオ実験初心者
初めて投稿させていただきます。
今月からCre-LoxP系のコンディショナルノックアウトマウスの管理を手伝うことになりました。

たくさん種類があるので、右も左も分からなくて勉強を始めたばかりです。
非常に基本的なことで申し訳ないのですが、コンディショナルノックアウトマウスの表記の意味がいまいち理解できていません。

例えば、Al-Cre/CBP-flox homoやColl-cre/CBP-flox homoと記載があります。

私の理解では、〇-cre/△-flox homoは、△が欠損した遺伝子で、欠損させる場所が〇という理解なのですが、正しいでしょうか?

また、Coll-cre/CBP-flox homoniついて勉強しようとしても検索にひっかかってこないのですが、表記が一般的ではないのでしょうか?Collはcollagenのことだと思うのですが...


こんな質問で申し訳ございませんが、ご教授いただけましたら幸いです。
宜しくお願い致します。

2件 ( 1 〜 2 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。