Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

Crispr/Cas9で作製したKOマウスの変異の解析 トピック削除
No.7910-TOPIC - 2019/05/22 (水) 16:52:31 - GS400
Crispr/Cas9システムを使ってKOマウスを作製しようと思います。
KOマウスのtailを使って変異が入っているか調べる場合、みなさんはどのようにして解析しているのでしょうか?
tailのgDNAをテンプレートにしたPCRとシーケンスを行う場合、ヘテロKOだとWTとKOのアリルが存在すると思うので、PCRでKOアリルをうまく検出できるのかなあと疑問に思ってます。
初歩的な質問で申し訳ありません。。。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



8件 ( 1 〜 8 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.7910-8 - 2019/05/28 (火) 19:26:20 - AA
樹立後のタイピングの煩雑さや、非定型翻訳などを考慮すると、
単にNHEJでフレームシフトでノックアウトするよりも、
2箇所で切って、KOドナーである程度のエクソンを
まとめて抜いてしまうほうが結果的には楽かもしれません。
F0で解析したい場合は不向きですが。

(無題) 削除/引用
No.7910-7 - 2019/05/28 (火) 13:54:47 - GS400
確かにそのやり方もありますね!!
参考になります、ありがとうございます!!

(無題) 削除/引用
No.7910-6 - 2019/05/25 (土) 02:07:43 - プラスミド
プラスミドにPCR産物をクローニングして、複数個拾ってシークエンスするのもありかもしれません

(無題) 削除/引用
No.7910-5 - 2019/05/24 (金) 16:19:29 - GS400
受託ではなく、1から樹立を目指してます。
私もシーケンスで確認することを考えてます。
各アリル特異的なプライマーでPCRも安易な方法でよいですね。

(無題) 削除/引用
No.7910-4 - 2019/05/24 (金) 09:12:46 - GLUT4
樹立から始められるのでしょうか?
私は受託でノックアウトマウスを作製してもらいましたが、ジェノタイピングPCRは各アリル特異的なプライマーでPCRをしています。

シークエンスは最初に確認はしました。

(無題) 削除/引用
No.7910-3 - 2019/05/24 (金) 09:07:15 - GS400
おおさま、アドバイスをありがとうございます。
制限酵素部位をみつけて試してみようと思います。
とても助かりました。

(無題) 削除/引用
No.7910-2 - 2019/05/23 (木) 01:09:30 - おお
デザインの段階で制限酵素認識部位が潰れたりするようにできれば(また偶然潰れたクローンとか、偶然認識配列ができたクローンとか)、PCR後制限酵素処理で見れると思う。

PAGEなら5ベースも長さが違うと検出できる。

Crispr/Cas9で作製したKOマウスの変異の解析 削除/引用
No.7910-1 - 2019/05/22 (水) 16:52:31 - GS400
Crispr/Cas9システムを使ってKOマウスを作製しようと思います。
KOマウスのtailを使って変異が入っているか調べる場合、みなさんはどのようにして解析しているのでしょうか?
tailのgDNAをテンプレートにしたPCRとシーケンスを行う場合、ヘテロKOだとWTとKOのアリルが存在すると思うので、PCRでKOアリルをうまく検出できるのかなあと疑問に思ってます。
初歩的な質問で申し訳ありません。。。

8件 ( 1 〜 8 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。