Bio Technical フォーラム

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一括でのアミノ酸組成計算tool トピック削除
No.8665-TOPIC - 2020/02/18 (火) 10:57:54 - Tokio
お世話になっております。
先日sub cellular localizationでお世話になったのですが、似たようなbioinformaticsとして、
2000種類の蛋白質の中のアミノ酸組成を一括でリスト化する方法はありますでしょうか？
酸性アミノ酸、塩基性アミノ酸、芳香族などの割合で分類したいと考えています。
宜しくお願いいたします。
　
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No.8665-4 - 2020/02/19 (水) 14:07:37 - Tokio
ご回答ありがとうございます。
これを機会に頑張ってみます。

(無題) 削除/引用
No.8665-3 - 2020/02/18 (火) 15:05:16 - ちき
qqさんのおっしゃるように、これを機会に何らかのスクリプト言語について勉強しておくのはいい考えだと思います。"Don't invent the wheel twice."とはよく言われますが、アミノ酸のカウント程度ならよい演習問題なので、何回でもinventしてよいのでは。

なお、もとの質問の内容自身は、excelだけでもできるはずです。

(無題) 削除/引用
No.8665-2 - 2020/02/18 (火) 11:43:01 - qq
そんなウェブサービスを探しているのだろうけど、この際、自分で作ればいいんじゃない？
タイミング的に決して悪い選択ではないと思う。
anaconda, biopythonとそれぞれのマニュアルが必要です。

一括でのアミノ酸組成計算tool 削除/引用
No.8665-1 - 2020/02/18 (火) 10:57:54 - Tokio
お世話になっております。
先日sub cellular localizationでお世話になったのですが、似たようなbioinformaticsとして、
2000種類の蛋白質の中のアミノ酸組成を一括でリスト化する方法はありますでしょうか？
酸性アミノ酸、塩基性アミノ酸、芳香族などの割合で分類したいと考えています。
宜しくお願いいたします。
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