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等電点電気泳動の電圧 トピック削除
No.868-TOPIC - 2012/08/25 (土) 16:34:01 - qq
BIORADのPORTEAN IEFで等電点電気泳動するときに、泳動時間が一定しません。
具体的には、4,000V maxの条件で20,000VHの泳動をしていますが、電圧が2,000V程度でだらだら泳動されることがあり、結果的に泳動時間が5-6時間のところが、8-10時間かかってしまうことがあります。
IEFサンプルのローディングは50V over-nightでactive-loadingしています。その後20,000VHの電気泳動になります。
IEFサンプルの調整法か、active-loading後の吸着し残したサンプルの除去が大切なのかとは思っているのですが、それでも電圧を最大(4,000V)に維持できないときがあります。
同じような経験のある方や、こうすれば良いとのご意見をお教えください。
 
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(無題) 削除/引用
No.868-5 - 2012/08/27 (月) 06:35:32 - おお
あまりおやくにたてませんでした。回答の履歴からしておそらくもうご存じのことではないかとはおもってはいたのですが。

同じサンプルでも違いが出てしまうんですね。。。違うサンプルですが同じプレパレーションでもぶれはあるんですが電圧はやはり上がってくるというのは経験があります(ただしバイオラットではないんですが)。

ちょっとお使いのマシンは詳しくないので想像でかいてしまいますが、サンプルが同じなら何か要因はほかのところにあるのでしょうね。たとえばストリップの裏に溶液が流れ込んで通電してしまったりしているとか、、、

まあ今回もおやくにはたてなそうです。

(無題) 削除/引用
No.868-4 - 2012/08/26 (日) 09:14:41 - qq
ご返事ありがとうございます。
サンプルは、TCA沈殿+エタノールリンスしたものをCHAPS/Urea/thioureaで溶解したものです。
ご指摘のように、塩やその他の夾雑物にはそこそこ注意しているつもりなのですが、同じサンプルですら、最大電圧がmaxに到達しない時があるので、こちらの気づいていない点があるのかと思って質問したわけです。
サンプルをロードしたIEFストリップの周りの水分や余分なサンプルが電圧を低下させているのかなと思っており、高電圧負荷する前にIEFストリップの余分な水分を良く取り除くことが必須なのかなあと今は思っています。

(無題) 削除/引用
No.868-3 - 2012/08/26 (日) 06:36:35 - おお
まだ試していないようでしたら、とうでんてんにかける前に透析というてはあると思います。

(無題) 削除/引用
No.868-2 - 2012/08/26 (日) 04:16:43 - おお
おそらくご存じかとおもいますが、サンプル中の塩濃度が高いと電圧が上昇しません。塩濃度に限らずサンプルの量でも初期のイオン強度が変わってきますし、サンプル溶液中に電離度が高い物があるとある程度電流が流れっぱなしです。塩はNaClのようなものに含め、電離度が比較的高いデタージェントなども影響するかもしれません。

ただしイオン強度が高い塩は最終的には両電極まで移動しますので、電極とストリップの接点あたりの溶液を頻繁に変えると徐々に電圧が上がってくると思いますが、それでも結構時間がかかると思います。

すみません一般論ぐらいのことしかかけませんでした。

等電点電気泳動の電圧 削除/引用
No.868-1 - 2012/08/25 (土) 16:34:01 - qq
BIORADのPORTEAN IEFで等電点電気泳動するときに、泳動時間が一定しません。
具体的には、4,000V maxの条件で20,000VHの泳動をしていますが、電圧が2,000V程度でだらだら泳動されることがあり、結果的に泳動時間が5-6時間のところが、8-10時間かかってしまうことがあります。
IEFサンプルのローディングは50V over-nightでactive-loadingしています。その後20,000VHの電気泳動になります。
IEFサンプルの調整法か、active-loading後の吸着し残したサンプルの除去が大切なのかとは思っているのですが、それでも電圧を最大(4,000V)に維持できないときがあります。
同じような経験のある方や、こうすれば良いとのご意見をお教えください。

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