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C3 protease認識配列 トピック削除
No.8743-TOPIC - 2020/03/31 (火) 07:40:25 - 3C
お世話になります。

大腸菌にて組換えタンパク質を発現させたいのですが、その際のデザインは

Protein X - HRV C3認識配列 - His6 tag - HA tagです。

一つ教えていただきたいのですが、Protein XとHRV認識配列の間にはいくつかアミノ酸を挿入した方が、C3 proteaseの認識を確実なものとしますでしょうか?

C3 protease recognition preferenceなどで調べても見つかりませんでした。
ただ、GEのpGEX-6P1ではGSTとHRV C3認識配列の間にS, Dの2アミノ酸が挿入されていました。

もちろんProtein XのC末側がタンパク質の表面に出ていることが重要だと思うのですが、構造情報は今の所利用できません。無難にS, Dの2アミノ酸か、GSリンカーを持たせるべきか、それとも必要なくいくか、で悩んでいます。

アドバイスをいただけませんでしょうか?
よろしくお願いいたします。
 
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(無題) 削除/引用
No.8743-2 - 2020/04/01 (水) 12:24:43 - 3C
すみません、ageさせてくださいm( )m

C3 protease認識配列 削除/引用
No.8743-1 - 2020/03/31 (火) 07:40:25 - 3C
お世話になります。

大腸菌にて組換えタンパク質を発現させたいのですが、その際のデザインは

Protein X - HRV C3認識配列 - His6 tag - HA tagです。

一つ教えていただきたいのですが、Protein XとHRV認識配列の間にはいくつかアミノ酸を挿入した方が、C3 proteaseの認識を確実なものとしますでしょうか?

C3 protease recognition preferenceなどで調べても見つかりませんでした。
ただ、GEのpGEX-6P1ではGSTとHRV C3認識配列の間にS, Dの2アミノ酸が挿入されていました。

もちろんProtein XのC末側がタンパク質の表面に出ていることが重要だと思うのですが、構造情報は今の所利用できません。無難にS, Dの2アミノ酸か、GSリンカーを持たせるべきか、それとも必要なくいくか、で悩んでいます。

アドバイスをいただけませんでしょうか?
よろしくお願いいたします。

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